本研究系统测定了自主选育的C3、C4两个蛋鸡新品系的生产性能,并分析了二系杂交的效果,为品系进一步选育、配套系育种提供参考。试验测定C3、C4系蛋鸡1～18周体重,18和32周体尺,C3和C4系正交（C3♂×C4♀）与反交（C4♂×C3♀）0～18周体重,40周龄测定C3、C4系蛋鸡及其正交后代的蛋品质,52周取C3、C4及其正交的卵巢组织各3个样进行转录组测序,利用Gompertz、Logistic、Von Bertalanffy模型对生长和产蛋数进行拟合,运用Wood、Mc Millan、Yang-Ning模型对产蛋率进行拟合,同时还分析了体尺与蛋品质各性状的杂种优势,结果表明:1.C3系蛋鸡羽色为黑白花色,五趾,18周平均体重1064.38g,群体50%产蛋率日龄179d,高峰产蛋率达73.22%,42周入舍鸡蛋数86.43枚,40周龄平均蛋重46.21g,C4系蛋鸡羽色深红,四趾,18周平均体重1302.85g,群体50%产蛋率日龄147d,高峰产蛋率达93.70%,42周入舍鸡产蛋数135.30枚,40周龄平均蛋重57.13g,两个品系1～18周龄体重拟合效果最佳的是均为Von Bertalanffy模型（C3:R~2=0.993,C4:R~2=0.996）,产蛋率均以Yang-Ning模型拟合产蛋率效果最好（C3:R~2=0.999,C4:R~2=0.996）,累积产蛋数均以Von Bertalanffy模型拟合效果最佳,拟合度均在0.999。2.C3和C4系正交与反交后代均以黑色为基本羽色,颈部、腹部为黑白相间的麻羽,五趾,正交初生重39.70g,反交30.70g,4周龄前正交平均体重极显著高于反交（P＜0.01）,4周龄后体重无显著差异（P＞0.05）,生长曲线拟合正交以Von Bertalanffy模型拟合效果最佳,反交以Gompertz模型拟合效果最佳,拟合度达均到0.999。正交群体50%产蛋率为163d,高峰产蛋率88.90%,蛋壳粉色,40周龄平均蛋重51.53g;Yang-Ning模型对其产蛋率的拟合效果最佳（R~2=0.998）,产蛋数以Von Bertalanffy拟合效果最佳（R~2=0.999）。正交18周龄体重、体斜长、胸宽、胸深、胫围表现出杂种优势,胫长和龙骨长表现出杂种劣势,32周所有指标均表现杂种优势,40周龄蛋重和蛋形指数表现出杂种劣势。3.转录组测序研究表明,与C4相比C3中ZP3、MMP10、STC1等58个差异表达基因上调,AVBD9、TMEFF1、KK34等36个差异表达基因下调,与C3×C4相比C3中HOXA10、FOXL2、KTR5等20个差异表达基因上调,TWF1、ASB15、RASGRF5等10个差异表达基因下调,与C3×C4相比C4中LAMA4、PKIG、RPL18A等565个差异表达基因上调,SSTR1、SOUL、CFAP161等416个基因下调。通过对正交卵巢的基因进行杂种优势计算,共发现DAZL、WEE2、Piwil1、Mael等804个与繁殖性能相关的杂种优势基因。综上所述,通过对C3、C4系蛋鸡开展系统的种质特性测定和评价,并开展正反交杂交试验,可为品系的选育方向提供指引,为培育小型粉壳蛋鸡新配套系提供参考。