MGAM基因在家犬适应淀粉饮食中的机制研究

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慢慢历史长河,家犬(Canis lupus familiaris)已陪伴人类走过了上万年,是人类最值得信赖的伙伴之一。家犬既是第一个被驯化的物种,也是唯一一个被驯化的大型食肉动物。从狼到家犬的驯化过程中,至关重要的改变是家犬对高淀粉饮食的适应。目前已知家犬主要通过增加AMY2B基因的拷贝数而增加淀粉酶活性,以消化更多的淀粉物质,其下游基因之一的麦芽糖酶-葡糖淀粉酶基因(MGAM)能进一步水解淀粉中产生的糖类及其他来源的低聚寡糖以获得更多的葡萄糖,但其对促进家犬适应淀粉类食物的机制研究较少。本研究则立足于MGAM基因,进一步探讨家犬和狼对淀粉饮食适应的遗传机制。本研究中收集了627只家犬,以及46只狼的基因组数据,构成673个个体的基因组数据集,对数据集中的MGAM基因进行分析,并结合家犬小肠的ATAC数据库,在家犬和狼两个群体中筛选到14个高频SNP位点,推测这些位点可能具有启动子或增强子活性。将这些位点及周围片段分别插入到PGL3-basic和PGL3-promoter载体中,采用荧光双报告实验进行验证,证明了MGAM基因中的两个具有启动子活性的DNA片段。之后本研究进一步对这两个启动子区域中包含的三个SNP位点进行探索,发现chr16:7,215,916位点碱基变化会影响启动子活性,并且相比于狼中的chr16:7,215,916位点为T碱基时,家犬chr16:7,215,916位点碱基为C时具有较高的启动子活性,同时我们通过转录因子预测,预测到CTCF蛋白和TFAP2A蛋白可能是调控chr16:7,215,916位点及周围DNA片段启动子活性的候选转录因子,这两个转录因子在chr16:7,215,916位点更偏好C等位基因,该位点介导的启动子活性,可能改变MGAM基因在家犬和狼中的表达模式,这种表达模式可能会进一步促使家犬中MGAM基因表达量升高,提高家犬中MGAM二糖酶活性。这个发现可能部分解析了家犬能从淀粉中获得更多的葡萄糖,进而适应高淀粉饮食习惯的机制,为家犬在高淀粉饮食方面的适应研究奠定了基础。同时MGAM基因中两个启动子片段的验证,填补了科学界在家犬和狼中对MGAM基因转录调控区研究中的空白,也更好地揭示了家犬的驯化机制。
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