复杂模式的输入与输出的DEA效率评价一直是DEA理论研究的前沿问题。在许多实践研究中，由于系统的复杂性，同时又因为人们对系统单元指标观察存在很多的主观测量误差以及系统误差，这使得普通的DEA方法对效率的评价受到了较大的干扰。人们往往只关注近期信息，并根据自己的知识与经验采用传统的DEA方法获得各系统单元的效率评价值，而很少考虑以往的数据信息的滞后性的影响。这样得出的评价结果没用充分利用数据的价值，从而使结论缺少说服力。比如，多个时期（多重层次）的输入与输出的系统，人们就很少考虑以往的信息的影响。这方面，在DEA理论研究中也涉及较少。本文正是从这个角度综合各个时期（阶段或层次）的信息对系统单元的一个有效性比较。　　 首先，笔者结合目前国内外研究的背景，浏览近期各类文献，并系统地综合了国内外在DEA理论、模型和方法方面的进展研究。同时，文中提出复杂系统输入与输出模式的效率评价问题，在该种系统情形下，并且有针对性的对该种情形进行了讨论，从而给出了矩阵式输入与输出模式的概念。　　 其次，笔者针对复杂的输入与输出形式进了DEA模型改进，并结合原有数据包络分析理论及方法，而后对改进后的模型做了理论论证。同时也在复杂输入输出系统情形下的改进模型的求解过程的处理进行了探讨。　　 最后，改进模型的原理在理论得到充分证明后，通过改进的模型对我国十四家上市商业银行进行了实证研究。案例结合多个跨期数据的信息进行了综合评价，通过计算得出了不同单元的时间权重值，从权重值可知到要使效率值达到最优的比重，从而给决策者带来另一面的参考价值。