从个人消费到企业运行、从会计记账到税收征管,发票始终是无法回避的一个话题。随着我国经济社会的不断发展变化,我国的发票也经历了几个重要的发展阶段,“以票管税”概念的提出也让发票对于税收的重要性更为社会所普遍接受与认可。税务机关作为发票主要主管部门对发票的管理一直以来都是高度重视的,从人工管理到系统管理再到信息化管理,发票的管理模式也随着社会与技术的不断发展而与时俱进。2016年5月,“营改增”在全国范围全面推行,由此增值税的征税范围进一步扩大,税务部门对增值税的管控难度也随之不断加大,增值税发票逐步成为纳税人生产经营活动中使用范围最广、使用数量最多、使用频率最高的发票。与增值税管理息息相关的增值税发票管理同样面临巨大的挑战。2016年金税三期在全国范围内的全面推广,税务主要业务系统原先的省市集中管理模式向全国集中管理模式转变,作为金税三期业务系统重要组成部分的发票管理模式也随之发生变化。面对金税三期系统,发票管理(内部管理、外部管理、日常监控分析、后续管理)模式与原上海综合征管软件模式下的变化较大,在总局数据大集中的趋势下,基层税务部门必须积极适应金税三期系统下发票的管理模式。依托金税三期工程,使税务机关发票管理工作更趋于程序化、规范化、智能化。然而,在全面“营改增”和金税三期上线的双重背景下,利用增值税发票进行的犯罪行为却逐渐显现并不断扩张。国家税务总局于2016年起在全国范围内开展增值税发票专项整治行动,一举破获多起重大发票违法案件。大量发票违法行为的存在,直接影响了国家税收征管工作的有效进行,这不禁让我们进一步思考目前的增值税发票管理模式,并寻求更有效、更优化的管理手段和方法。正是带着这样的疑问,笔者运用案例分析法,通过网络报道及实际税务工作中的相关案例,收集了金税三期上线后的部分虚开增值税发票案例,并选取A特大虚开增值税发票团伙案稽查案例进行分析。由于此案例涉税金额巨大,既涉及增值税专用发票也涉及增值税普通发票,犯罪人员众多,涉及地域范围广,对此案例的分析具体一定的典型性。本文以金税三期系统下增值税发票管理中存在的问题及对策探究为主题,首先,介绍了论文的研究背景和研究方法,从我国发票管理制度研究、目前我国增值税发票管理的现状和问题研究以及加强我国增值税发票管理的对策研究三方面对学术文献进行了梳理;然后,以目的为导向,通过对金税三期系统下增值税发票管理的现状解析,包括对金税三期后增值税发票管理模式的变化及风险分析,结合对A特大虚开增值税发票团伙案稽查案例的分析,找到当前增值税发票管理中存在的不足和有待改进之处,并分析问题成因;最后,以发票信息化管控,加强增值税发票的风险管控为重点,对如何在金税三期系统下进一步加强增值税发票管理提出思路和相关建议对策。