结核分枝杆菌耐丙硫异烟胺基因突变的研究

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目的:了解结核分枝杆菌临床分离株耐丙硫异烟胺相关基因的突变情况以及与结核分枝杆菌药敏表型的相关性,为丙硫异烟胺临床应用提供参考。方法:收集2015年3月~2018年3月肺结核患者的临床痰标本进行萋尔-尼尔逊氏染色法、结核分枝杆菌培养,将培养成功的结核分枝杆菌临床分离株行药物敏感试验,获得170例有药物敏感试验结果的临床分离株,其中111例敏感和59例耐药。用CTAB法提取菌株DNA,对丙硫异烟胺耐药基因inhA、ethA和ethR行聚合酶链式反应扩增并送基因测序,将测序结果与NCBI数据库中标准菌株H37Rv序列比较分析,将突变情况与结核分枝杆菌的药敏表型分析比对,了解丙硫异烟胺耐药基因inhA、ethA和ethR突变与药敏表型的相关性。结果:本研究共获得结核分枝杆菌临床分离株170例,初治111例,其中敏感70例,耐药41例(单耐药13例,多耐药11例,耐多药11例,广泛耐药6例),复治59例,其中敏感19例,耐药40例(单耐药2例,多耐药7例,耐多药22例,广泛耐药9例)。分别对耐丙硫异烟胺相关基因inhA、ethA和ethR进行PCR扩增和基因测序分析,inhA基因在170例临床分离菌株中出现4例发生突变,其中2例为非同义突变,2例为同义突变,总突变率1.18%(2/170)。非同义突变中,1例出现在初治患者的敏感结核分支杆菌中,在敏感株中的突变率为1.1%(1/89),突变形式为GAA62GGA(Glu62Gly);另1例出现在复治患者的耐多药结核分支杆菌中,在耐药株中的突变率为1.2%(1/81),突变形式为GCC190TCC(Ala190Ser)。InhA基因GAA62GGA与GCC190TCC突变的2例结核分枝杆菌中,PTO药敏表型显示敏感;而在PTO药敏表型耐药的2例结核分枝杆菌中未检测到inhA基因的突变。结核分枝杆菌inhA基因GAA62GGA突变与GCC190TCC突变的PTO药敏表型显示敏感,但inhA基因GCC190TCC显示异烟肼表型耐药。结核分枝杆菌inhA基因GAA62GGA与GCC190TCC突变目前未见报道,为新型突变位点。在170例结核分枝杆菌临床分离株中未检出ethA和ethR基因的突变。结论:本研究发现结核分枝杆菌inhA基因2个新的突变位点GCC190TCC(Ala190Ser)和GAA62GGA(Glu62Gly),已上报Gen Bank,基因库号为分别为MK674461、MK674460;未检测到ethA与ethR基因突变。结核分枝杆菌inhA基因GCC190TCC(Ala190Ser)和GAA62GGA(Glu62Gly)突变与丙硫异烟胺耐药表型无明显关系,但GCC190TCC突变可能与异烟肼相关,为丙硫异烟胺与异烟肼的临床应用提供参考。
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