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对我国浙江、河南、山西、湖南、山东,湖北等半夏主产地的三叶半夏(Pinellia ternata(Thunb.) Breit.)进行病毒检测,并对分离所得的7个大豆花叶病毒(Soybeen mosaic virus,SMV)进行了核苷酸和氨基酸水平的分子系统学分析。 对收集的29个样品进行了黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)、芋花叶病毒(Dasheen mosaic virus,DsMV)、SMV的DAS-ELISA检测及分子生物学鉴定。在DAS-ELISA检测中发现SMV呈阳性的样品,均呈阳性。为了进一步确定该线状病毒,我们用马铃薯Y病毒属(Potyvirus)通用引物和CMV基因组RNA3全长序列扩增引物,通过RT-PCR方法扩增出了CMV及Potyvirus的对应片段。通过测序和序列比对进一步确定其分别为CMV与SMV,而后者不是的DsMV,由此确定侵然我国半夏的病毒主要为SMV及CMV,我国三叶半夏普遍受到这两种病毒的侵然侵染。其中CMV的检出率为48.2%;SMV的检率42.4%;有些样品还存在两个病毒的复合侵然。通过SMV、CMV的CP的氨基酸水平序列比对发现:相对来说,SMV半夏分离物与SMV大豆分离物有较大的差异,同源性在80.1%-81.3%之间;CMV半夏分离物根据CP的分组属于CMV组Ⅰ。 将SMV阳性样品进一步研究测序,并将所得的7个SMV分离物的外壳蛋白CP基因与其他分离自大豆的SMV、分离自半夏的SMV、分离自其他天南星科植物的DsMV以及侵然葫芦科的西瓜花叶病毒(Watermelon mosaic virus,WMV)对应基因进行了核苷酸和氨基酸水平的分子系统学分析。结果表明,SMV CP基因核苷酸同源序列具有较高的寄主相关性和部分地域相关性,而氨基酸同源序列的寄主相关性明显高于地域相关性。侵染半夏的SMV的N端高度变异区是SMV普通株系和WMV基因重组的结果,在进化中承受选择压力。CP保守区的氨基酸序列是决定蛋白功能的主要部分,其序列相似性很高,种间差异较小。本研究初步揭示了SMV作为单链RNA病毒通过快速变异和重组以适应不同寄主的进化趋势。