代持股权作为股权投资领域中的一类特殊股权,在商事活动中展现出了许多积极意义,主要表现为聚集零散的资金,达到社会资源配置的优化。同时,由名义股东集中行使原本分散的股权,能提升公司决策效率。在保护实际出资者隐私上,代持股权也具有天然的优势,《公司法司法解释（三）》制定后,其已然成为投资者隐藏个人信息的一种合法途径。但也正因为代持股权其股权设置的复杂性与隐蔽性,加之国内有关的法律与税收政策不完善,在对代持股权课税时,征纳双方极易产生争议。总局“2011年第39号公告”的颁布,给出了一个看似合理的征税方式,其注重对名义股东课税,在收益转交隐名股东环节不予课税。但随之而来却也引发了更多问题,包括重复征税、多征税和少征税等。此外,39号公告的适用范围也一直存在争议,公告仅对股权分置改革形成的企业代个人持有的限售股进行了征税方式的说明,并无条款表明可以将其使用至其他形式的代持股权之中。代持股权本身的复杂性以及相关政策的不完善,造成了当前税务领域中与其相关的纠纷争议不断,既破坏了税法的基本原则,也给税务部门的工作带来了巨大的负担。为了更好的开展代持股的税款征收工作,建立完善的代持股权课税政策显得尤为重要,本文便尝试开展这一研究。本文从代持股权相关的理论出发,运用案例分析法对我国代持股权存在的问题进行研究,并在进行充分的文献研究的基础上,对如何完善我国代持股权的税收政策提出具体建议。首先,文章对代持股权相关的概念进行介绍与界定,随后介绍了制定代持股权课税政策的相关理论,包括信息不对称理论、交易定性理论与实质课税理论,并对代持股权的课税效应进行分析。第二章为现状分析章节,总结梳理了我国与代持股权相关的政策法规,并分税收政策与民商法规定两大板块进行分类分析,阐述我国现阶段政策规定存在的不足之处,指出代持股权因此产生的一系列税务问题,主要有纳税主体的认定、隐名股东显名化、代持股权对外转让以及隐名股东之间转让股权四大涉税争议问题。为进一步深化研究,本文选取了一则代持股权的典型案例进行分析总结,阐明了实务中代持股权课税过程中出现的争议问题,通过对争议的深度分析找出其产生的主要原因与众多争议中根源之争议所在,同时提出遵循实质课税原则解决争议的可能。在最后一章中,本文结合国内代持股权税务处理现状以及相关文献,分税收实体法与税收征管两部分提出政策建议。首先针对课税过程中应解决的根本问题即纳税主体的认定问题,提出在实质课税原则的指引下进行实体法的完善;在税收征管政策的建议中,提出建立完善的股权代持协议制度,以解决课税过程中代持股权隐蔽性所带来的困难。