高新区作为发展中国家高新技术产业和战略新型产业的前沿阵地,越来越被人们所重视。高新区区别于普通意义上的开发区的一个显著的特点就是:高新区在传统产业开发区的基础上融入科学技术、新工艺和新技术,把科技和创新作为其发展的关键,加速成果转化和科技创新。因此,科技创新是高新区发展的生命力所在,如今,科技创新的发展已经成为推动高新区高新技术产业发展壮大的重要因素之一。本文立足于我国现有的国家级高新区,从不同角度对我国现有国家级高新区的现状进行分析,找出其在科技创新发展中存在的问题,针对这些问题,找出影响高新区科技创新发展的因素,并对其进行评价分析,为我国高新区科技创新的健康快速发展提供有效依据。在相关理论研究的基础之上,本文选取了2007——2014年间的114个样本,8个科技创新能力评价指标,采用多指标面板数据因子分析的方法,对其进行科技创新能力评价,共提取出科技活动投入和科技活动产出两个公共因子,依次计算其因子得分和综合得分,最终求出面板数据综合总得分,根据得分找出各因素对高新区科技创新影响的程度,并据此提出提高科技创新能力的方法对策。研究表明,目前我国国家级高新区科技创新的发展水平受科技创新投入和产出这两个方面的影响较大,尤其应注意科技资金、科技人员的数量和质量方面的投入。中东部发达地区以及东部沿海地区的高新区应注意科技投入的使用效率以及科技产出的使用质量等,中西部以及欠发达地区的高新区在提高科技创新能力方面应结合自身情况、利用自身已有优势采取合理有效措施。所以,在提高科技创新能力的实践中,对高新区对症下药,将会取得事半功倍的效果,才能使高新区在发展中不断壮大。