2007年8月美国次贷危机席卷美国、欧盟和日本等世界主要金融市场,随后欧洲债务危机接踵而至,一连串的经济动荡导致世界经济陷入低谷。大批中小企业关门歇业,失业率居高不下,各国经济正经历着近年来最为动荡的时期。我国作为世界第二大经济体,在这样的外部环境下经济依然能够保持平稳增长,我国大中型企业复杂产品系统的稳定运转在其中起到了举足轻重的作用。持久的创新能力可以推动一个企业或者一个行业持续向前发展。当前,我国大中型企业复杂产品系统的自主创新正处于攻坚的关键时期,成败直接关乎企业生存发展的安危。然而在创新过程中,却有许多限制因素严重阻碍我国大中型企业创新活动的健康发展。鉴于此,本文提出了专利壁垒以及创新投入不足是构成复杂产品系统自主创新的限制因素,并深入剖析二者作用机理,这也是本文最大的一个创新点。在归纳限制因素的时候,运用了多元回归分析和实证分析等分析工具,将定性的结果用数据分析的结果加以验证,使研究结果更具有说服性。与此同时,本文在案例分析过程中,应用了中国高铁的自主创新作为案例进行分析,这在本文当中是一个亮点也是一个创新之处。我国高铁的“自主创新”是近年来国内外专家争论的话题,我们以事实、数据为依据说明我国高铁是如何进行自主创新的,以此来捍卫中国高铁的“自主产权”。最后我们提出相应的解决方案和措施,使我国大中型企业复杂产品系统的自主创新过程中能够有章可循,为企业采取相应措施应对和克服这些限制因素提供了理论基础。文章首先介绍了选题的背景、目标以及意义,定义了复杂产品系统的概念和特征；其次,以国内外学者的研究成果为基础,建立回归模型进行相关性分析,以及运用柯布——道格拉斯生产函数进行实证分析,从中归纳总结出我国大中型企业复杂产品系统自主创新的限制因素；再其次,以中国高铁、汽车行业在自主创新中遇到的限制因素进行案例分析,对各个限制因素在实际生产中的作用机理加以具体的分析；最后,根据我国大中型企业复杂产品系统的自主创新现状,结合我国政府颁布的相关政策、法规,提出克服限制因素的措施和对策。