京津冀金小蜂科DNA条形码

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科学准确的鉴定物种是进行更深层次生物学研究的基础和前提。物种的形态鉴定需要分类学家投入足够的时间和精力,更需要多年经验的积累。金小蜂科是一类重要的天敌昆虫,对控制害虫种群密度起着重要的作用。但金小蜂个体微小、形态多样,是小蜂总科最难鉴定的类群。近几年DNA条形码作为鉴定物种的有效手段得到了广大学者认可。随着研究的深入,部分学者认为COI基因本身存在一些问题可能会干扰物种鉴定,如线粒体异质性、Wolbachia感染、核线粒体假基因等。基于上述原因,近年来有学者尝试将核糖体第二转录间隔区(ITS2)作为DNA条形码的补充。因此,本研究选择COI基因和ITS2作为DNA条形码,对2015-2016年于京津冀地区采集的金小蜂进行物种鉴定。经过整理,本次采集共得到568头金小蜂标本。根据标本采集信息和形态鉴定结果将标本分为325组。随后提取标本基因组DNA,扩增COI序列和ITS2序列,得到的序列经过校对、拼接、对齐、剪齐后,分别构建COI和ITS2的NJ树,并使用ABGD、j MOTU等方法对样本的COI序列划分分子可操作分类单元。最终,COI、ITS2序列分析共涉及288头京津冀金小蜂标本和14头非京津冀地区金小蜂标本。同时获得COI和ITS2序列的标本共166头,结合ABGD、j MOTU、NJ树三种方法的分析,最终将166头标本划分为54分子可操作分类单元。同时参考划分结果中三种方法对应的各项参数,对只有COI或只有ITS2序列的标本进行分析,最终将302头标本划分为96分子可操作分类单元。分析还得到以下结果:(1)获得COI序列的标本227头被划分为72分子可操作分类单元;获得ITS2序列的标本241头被划分为83分子可操作分类单元。(2)根据划分的分子可操作分类单元,部分属级形态鉴定不确定的属(Arthrolytus、Callimerismus、Chlorocytus、Eurydinota、Sphaeripalpus)属级阶元不成立;Pteromalus、Gastrancistrus、Trichomalopsis部分属级形态不确定的标本的属级阶元得到肯定;部分形态鉴定为Cyrtoptyx、Nasonia、Propicrocytus、Pteromalus标本的属级阶元建议更正。(3)根据划分的分子可操作分类单元,对部分形态鉴定不确定的或形态鉴定有误的种提出了分类建议;成功将9头无形态鉴定结果的标本鉴定至种。(4)新增5中国新纪录属,分别为Dinarmus、Dinotoides、Heteroprymna、Sympotomus、Synedrus;京津冀新增记录8属,包括Ablaxia、Agiommatus、Ammeia、Cerocephala、Gastrancistrus、Hyperimerus、Norbanus、Zdenekiana。综上,COI和ITS2鉴定物种非常有效,本研究成功对98%的标本进行了物种鉴定。但少数标本的COI序列遗传距离存在模糊地带,导致分种不明确。分析过程中发现ITS2本身种内高度保守,可以对COI起到非常好的验证和补充作用。此外,实验中发现Spalangia的所有标本均未能成功扩增COI序列,但多头标本成功扩增到ITS2序列,因此,将ITS2作为DNA条形码的补充片段很有必要同时选用COI基因和ITS2,不但增加了分子鉴定的说服力,排除了COI基因单独使用可能存在的问题,更对分析过程中避免了种内遗传距离界定而导致分种不清的情况。此外,目前金小蜂科的大多数物种尚无可靠的条形码,因此物种鉴定很大程度依赖于形态鉴定结果。对于无形态鉴定结果,且无条形码的物种,只能将其与其他物种分开而不能确定其为何种。可见,形态鉴定与分子鉴定密不可分,相辅相成。同时,构建DNA条形码金小蜂科样本数据库非常必要,只有积累更多的物种,才能更好的达到物种鉴定的目的。
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