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目的:研究亳芍不同时期不同组织部位内生真菌的种类、分布,分析并筛选出抗病原菌的优势菌属。进一步研究其次生代谢产物,以期得到具有结构新颖活性先导化合物。为道地药材亳芍资源进一步研究及质量控制奠定基础。方法:运用组织块分离法和分子生物学技术对亳芍不同时期不同织部位的内生真菌进行分离鉴定,对所分离得到的内生真菌进行生物学统计,分析其多样性和群落结构。采用十字交叉法筛选出抗植物病原真菌活性较好的优势菌株。对所选菌株中的优势菌种进行固体发酵,运用各种色谱方法和波谱技术进行分离鉴定次生代谢产物。结果:从亳芍中共分离509株内生真菌分属于18属31种,其中分离频率、丰富度指数及多样性指数均表明夏秋两季中亳芍内生真菌种类丰富,且根部分离得到的内生真菌种类最丰富。其中Penicillium、Alternaria、Fusarium菌属分离频率较高,18属内生真菌中Alternaria alternata、Ceratobasidium ramicola、A s p e r g i l l u s s p.、Talaromyces minioluteus、Acrocalymma aquatica、Cladasporium uredinicola、F u s a r i u m e q u i s e t i、Colletotrichum spaethianum、Fungal endophyte和Penicillium mariae-crucis 10种真菌为各属中分离频率最高的菌属,分离频率均大于2%,为优势菌属。抗菌活性实验表明,从亳芍中分离得到的10种内生真菌具有普遍的抗植物病原真菌活性。P.mariae-crucis乙酸乙酯萃取物对6种病原真菌具有相对较高的抑菌效果,A.alternata对花生叶斑菌的抑菌率达到7 5%,A.s p.、T.minioluteus、A.aquatica、F.e q u i s e t i对6种病原真菌抑菌效果中等,基本达到25%以上。18属内生真菌中P.mariae-crucis乙酸乙酯萃取物对金黄色葡萄球菌的抑菌最小浓度为64μg/m L。A s c o c h y t a p h a c a e菌株的乙酸乙酯萃取物对白色念珠菌的最小抑菌浓度为128μg/m L。从两株优势菌种（A.alternata和P.mariae-crucis）中分离并鉴定45个单体化合物,分别为alternate A（1）、alternate B（2）、alternate C（3）、alternate D（4）、alternate E（5）、alternate F（6）、TCA ma1（7）、TCA ma2（8）、TCA ma3（9）、TCA ma4（10）、TCA ma5（11）、TCA3 b（12）、TCA3 a（13）、TCA A（14）、甲基4乙酰氨基-3-羟基苯甲（15）、（E）-甲基5-羟基-3-甲基戊二烯（16）、异苯并呋喃酮A（17）、对羟基苯乙酮（18）、6-hydroxy-isosclerone（19）、talarojlavone（20）、7-hydroxy-2-hydroxymethyl-5-methyl-4H-chromen-4-one（21）、alternarienonic acid（22）、2,5-dimethyl-7-hydroxychromone（23）、3-羟基-5-甲氧基苯甲酸（24）、5-hydroxyepialtenuene（25）、交链孢醇（26）、methyl m-hydroxybenzoate（27）、stemphyperylenol（28）、甲基-2-（4-羟基苯基）丙酸（29）、细格菌素（30）、交链孢烯（31）、djalonensone（32）、3-hydroxyalternariol 5-O-methyl ether（33）、altenuisol（34）、1-deoxyrubralactone（35）、penicmariae-crucis A（36）、penicmariae-crucis B（37）、penicmariae-crucis C（38）、penicmariae-crucis D（39）、（E）-2-methylhex-3-enedioic acid（40）、过氧化麦角甾醇（41）、β-谷甾醇（42）、O-methylcurvulinic acid（43）、甲基,2-（2-乙酰基-3-羟基-5-羟基甲氧基）苯基乙酸酯（44）、methyl 2-acetyl-3,5-dihydroxyphenylacetate（45）。其中Alternaria alternate菌中分离得到35个不同化合物（1-35）,其中化合物1-11为新化合物。Penicillium mariae-crucis菌中分离得到10个不同化合物（36-45）,其中化合物36-39为新化合物,化合物40为新天然产物。化合物36-45为首次从P.mariae-crucis真菌中分离得到。化合物3具有一定的抗肿瘤活性。结论:亳芍内生真菌群落结构丰富,不同季节及同时期不同组织部位内生真菌具有一定差异性。不同内生真菌其次生代谢产物表现出不同的抗菌活性。两株内生真菌A.alternata和P.mariae-crucis其次生代谢产物种类丰富且具有多样性。