由稻曲病菌引起的水稻稻曲病是世界范围内水稻生产上的一种重要的谷粒病害，近年来，随着气候环境和水稻品种的变化，该病害发生日益严重。稻曲病能降低水稻品质，影响水稻产量，稻曲病菌还能产生对人和动物有害的毒素。本研究通过对稻曲病菌随机引物扩增（RAPD）特异片段进行回收、克隆、测序。根据测序结果，设计SCAR引物，成功地将RAPD特异片段转化为稻曲病菌SCAR标记。利用特异性引物US-SF/US-SR，供试稻曲病菌均可扩增出一条257bp的清晰、明亮的条带，而其他病菌均无扩增产物。扩增的灵敏度为能检测出1pg的稻曲病菌DNA。进一步建立了稻曲病菌的巢式PCR检测体系，利用巢式PCR引物，在供试稻曲病菌中均可扩增出一条210bp的特异性条带，该方法能检测出10fg的稻曲病菌DNA，其灵敏性比常规PCR法好，可用于水稻植株和种子的带菌检测。为明确稻曲病对水稻产量的影响，了解福建省水稻新品种对稻曲病的抗性。田间调查了稻曲病病粒数对水稻秕谷率和产量损失率的影响，结果表明，随着单穗稻曲球病粒数的增加，水稻秕谷率和产量损失率呈上升趋势。当单穗病粒数在5粒以上时，引起产量损失率可达35%以上。采用室内人工注射接种和田间自然诱发方法测定评价了58个福建省水稻新品种对稻曲病的抗性。58个水稻品种中表现中抗稻曲病的品种有3个，占供试品种数量的5.17%，如福丰优366、粤两优673和广优7017，表现中感稻曲病的品种有18个，感稻曲病的品种有37个，分别占31.03%和66.79%。稻曲病的发生在水稻品种间存有明显差别，本研究在温室条件下以6个对稻曲病抗感程度不同的水稻品种农香21（抗）、泸优313（抗）、福丰优2号（中感）、福两优366（感）、花2号3301（感）和浦江6号（感）为材料，分析稻曲病发生与水稻植株生殖期性状的关系。结果表明，水稻品种对稻曲病的抗感程度与水稻叶耳间距和孕穗期、抽穗期的天数无必然的联系，但与穗型、每穗粒数、产量可能存有一定关系，表现为抗病品种的穗型比感病品种穗型松散，抗病品种的每穗着粒数及产量低于感病品种。