耻垢分枝杆菌MSMEG-6402基因的克隆、表达及功能鉴定

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结核病(Tuberculosis,TB)主要是由结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)感染引起的,多种耐药性结核菌株的出现以及临床抗结核药物的缺乏,致使结核病发病率呈逐年上升趋势,寻找新的药物靶点、开发能有效治疗多重耐药结核的抗结核药物亟待解决。细胞壁是分枝杆菌赖以生存的重要屏障,而聚阿拉伯糖是细胞壁的核心组分。聚阿拉伯糖基的活性供体被证实是聚十异戊二烯磷酸阿拉伯糖(Decaprenyl-phospho-arabinose, DPA)。近几年,随着磷酸核糖转移酶(Rv3806c)和差向异构酶(Rv3790/Rv3791)功能的揭示,DPA特异的合成途径逐渐被阐明,是由三个连续反应组成:(1)Rv3806c催化5-磷酸核糖焦磷酸(PRPP)转移到聚十异戊二烯磷酸(DP)分子上形成5-磷酸核糖聚十异戊二烯磷酸(5-P-DPR);(2)磷酸酶催化5-P-DPR分子上的5-磷酸基团水解形成聚十异戊二烯磷酸核糖(DPR);(3)Rv3790/Rv3791催化DPR生成DPA。在此途径中,催化5-P-DPR脱磷酸的磷酸酶尚未被鉴定。而与Rv3806c处于同一启动子的Rv3807c通过蛋白结构域预测具有磷酸酶功能结构域,该蛋白被推测催化5-P-DPR生成了DPR。非致病菌耻垢分枝杆菌的MSMEG-6402基因是Rv3807c基因的同源基因,本论文通过在大肠杆菌BL21(DE3)中将MSMEG-6402基因克隆、可溶性表达并纯化,建立MSMEG-6402蛋白的体外酶活测定方法,对MSMEG6402的功能进行阐明,这将有助于完善对于DPA合成代谢途径的认识以及寻找新型抗结核药物靶点。本研究的实验内容包括:1)构建pET16b-MSMEG-6402表达质粒,在BL21(DE3)中进行可溶性表达,并用镍-组氨酸亲和层析法对带有N-末端组氨酸标签的MSMEG-6402蛋白进行纯化,通过SDS-PAGE和Western-blotting对表达蛋白和纯化蛋白进行检测鉴定;2)由于5-P-DPR反应直接底物的缺乏,需要偶联Rv3806c参与的酶促反应来完成酶活检测,因此我们采用与MSMEG-6402相同的表达载体和菌株对Rv3806c蛋白进行可溶性表达并纯化,通过SDS-PAGE和Western-blotting进行检测鉴定;3)根据底物DP/PRPP和产物DPPR/DPR的性质及其消耗产出量的变化,分别采用孔雀石绿-钼酸铵测磷法、薄板层析法(TLC)以及质谱法(MS)对MSMEG-6402纯化蛋白的功能活性进行检测。研究结果如下:1)成功对MSMEG-6402基因和Rv3806c基因在大肠杆菌BL21(DE3)中进行可溶性表达,通过Ni-NTA纯化获得目的蛋白,分子量分别为20kDa和33kDa;2)建立MSMEG-6402蛋白功能活性的测定方法,对其磷酸酶活性进行鉴定:孔雀石绿-钼酸铵测磷法对反应生成的游离单磷酸进行检测,观察到MSMEG-6402蛋白参与的反应组明显的颜色和OD630值变化,阴性对照组与空白对照组结果相近;TLC法对反应产物DPPR和DPR进行检测,由于二者均为糖脂化合物,同时采用糖显色和脂显色,以DP和PRPP为底物对照,样品组有DPPR和DPR的生成,而阴性对照组只有DPPR的生成;MS法对底物DP/PRPP的消耗量和产物DPPR/DPR的生成量进行直接检测,结果显示DP/PRPP有一定量的消耗,同时DPPR/DPR有相应的峰出现。综上所述,本研究利用不同的方法对MSMEG-6402蛋白的功能进行了阐明,鉴定了其特异的磷酸酶活性,催化5-P-DPR生成DPR,进一步完善了DPA的合成代谢途径,在今后的研究工作中,我们将改善对MSMEG-6402蛋白的纯化方法,减少杂蛋白的含量,体外模拟DPA的合成通路,对MSMEG-6402蛋白在代谢网络中扮演的角色进一步阐述。
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