【摘 要】
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目的:AP1S1（Adaptor related protein complex 1 subunit sigma 1）在以往研究中被报道与恶性肿瘤的进展相关,但在乳腺癌中没有较全面的生物信息学分析。在本研究中,对AP1S1在乳腺癌中的临床病理特征和潜在的诊断及预后价值进行综合研究。方法:使用GEPIA数据库检索在乳腺癌中差异表达的基因并筛选得到本次研究的目标单基因AP1S1,使用The human
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目的:AP1S1（Adaptor related protein complex 1 subunit sigma 1）在以往研究中被报道与恶性肿瘤的进展相关,但在乳腺癌中没有较全面的生物信息学分析。在本研究中,对AP1S1在乳腺癌中的临床病理特征和潜在的诊断及预后价值进行综合研究。方法:使用GEPIA数据库检索在乳腺癌中差异表达的基因并筛选得到本次研究的目标单基因AP1S1,使用The human protein Atlas验证AP1S1在肿瘤谱系和乳腺癌组织、细胞中的表达。通过UALCAN数据库分析AP1S1基因表达水平和启动子甲基化水平与乳腺癌临床病理特征的相关性,筛选乳腺癌中与AP1S1表达呈正相关的基因,使用Metascape进行通路富集分析。通过TIMER数据库分析AP1S1与乳腺癌组织中肿瘤浸润免疫细胞的相关性,最后使用Kaplan-Meier Plotter绘制乳腺癌患者的生存曲线。结果:通过GEPIA数据库检索后发现AP1S1在乳腺癌中差异表达且与预后相关,但目前没有较全面的生物信息学分析,因此作为本次研究的目标单基因。The human protein atlas验证AP1S1在乳腺癌组织和细胞水平中的表达,结果显示,在正常乳腺组织标本的脂肪细胞中AP1S1呈低表达,在腺上皮细胞中呈中等表达,而肌上皮细胞中未检测到AP1S1蛋白。在浸润性导管癌及浸润性小叶癌中AP1S1呈中等表达。免疫细胞化学分析显示,AP1S1的荧光标记主要分布在MCF-7细胞系的高尔基体和囊泡。UALCAN数据库分析显示,AP1S1在乳腺癌组织中的表达水平高于正常乳腺组织（P＜0.05）。而在不同的乳腺癌病理特征亚组中,Ⅳ期乳腺癌的AP1S1基因表达水平高于Ⅰ期、Ⅱ期和Ⅲ期乳腺癌（P＜0.05）,三阴性和HER2过表达型乳腺癌的AP1S1基因表达水平均高于激素受体阳性乳腺癌（P＜0.05）。AP1S1启动子甲基化水平分析结果显示,在乳腺癌组织中的甲基化水平低于正常组织（P＜0.05）。在不同乳腺癌亚组中,Ⅱ期和Ⅲ期的AP1S1启动子甲基化水平高于Ⅳ期乳腺癌（P＜0.05）,HER2过表达型和三阴性乳腺癌的启动子甲基化水平均低于激素受体阳性乳腺癌（P＜0.05）,61岁到80岁的乳腺癌患者启动子甲基化水平高于21岁到60岁的患者（P＜0.05）。通过UALCAN数据库检索得到149个基因在乳腺癌中与AP1S1表达呈正相关（Pearson-CC≥0.3）,通路富集分析结果表明,复制起始识别复合物、DNA复制、nc RNA代谢以及蛋白质的靶向运输等通路被显著富集（P＜0.05）。肿瘤免疫浸润分析显示,AP1S1与髓源性抑制细胞和调节性T细胞的浸润水平呈正相关（Rho＞0,P＜0.05）,与CD4+T细胞、CD8+T细胞、造血干细胞和嗜中性粒细胞的浸润呈负相关（Rho＜0,P＜0.05）。Kaplan-Meier Plotter分析显示,高表达AP1S1的乳腺癌患者总生存期更差（Logrank P=0.035,HR=1.28）。结论:AP1S1在乳腺癌组织中的表达水平高于正常组织,且与患者的疾病严重程度相关。高表达AP1S1的乳腺癌患者预后更差,因此,AP1S1可作为乳腺癌患者诊断和预后的生物标志物。
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