小豆种质资源抗旱性筛选鉴定及相关基因关联分析

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小豆是一个重要的豆科作物,在全世界30多个国家种植。小豆是重要的淀粉、可消化蛋白质、矿物元素和维生素来源之一,被至少十亿人食用。在中国小豆产区主要在半干旱地区,鉴定抗旱种质资源,对小豆抗旱遗传育种研究具有重要意义。本研究以栽培和野生小豆种质资源为材料,探讨小豆苗期抗旱性特点,评价抗旱性状。筛选出抗旱性差异材料,进行生理生化分析。并对干旱胁迫处理的苗期表型性状进行全基因组关联分析。以苗期盆栽控水方式,对不同来源的325份小豆种质资源进行干旱胁迫试验。测定根系形态、株高、生物量和冠层萎蔫等9个性状,利用隶属函数值法、主成分分析和聚类分析进行抗旱性综合评价。结果表明干旱胁迫对小豆苗期这些性状影响显著,根冠比值比对照组高,总根表面积、总根体积、地上部干重、地下部干重、整株干重和株高值均低于对照组。各性状隶属函数值相关性分析显示隶属函数值平均值与总根表面积相关性最大。主成分分析表明第1主成分的载荷主要是总根表面积和总根体积。聚类分析将325份小豆种质资源聚类成抗旱型、中间型和敏感型3类,分别占供试材料的30%、28%、42%。由隶属函数值法和主成分分析法结合不同抗旱类型根系形态,可将总根表面积作为小豆苗期抗旱性评价的主要指标。初步筛选出20份抗旱小豆资源材料,为进一步抗旱育种利用和抗旱基因挖掘提供了基础材料。选择10份抗旱性差异明显的野生和栽培小豆材料,进行苗期聚乙二醇(Polyethylene glycol,PEG)模拟干旱胁迫,测定叶片相对含水量、丙二醛含量、脯氨酸含量、光合指标等生理生化性状。结果表明抗旱性强的材料具有较强的叶片保水能力,水分亏缺小,脯氨酸增加较多,细胞质膜完整性较好,净光合速率下降幅度较小,蒸腾速率和气孔导度下降较大,对水分利用效率较高。综合抗旱隶属函数值表明,供试材料抗旱性为野生抗旱材料>栽培抗旱材料>野生敏感材料>栽培敏感材料。结合苗期抗旱表型数据和325份栽培和野生小豆种质资源重测序数据,利用1110535个SNP标记对小豆苗期抗旱性进行全基因组关联分析。使用优化压缩混合线性模型,在P<3.07×10-7水平下,共关联到40个与抗旱显著关联的SNP位点。通过筛选显著关联位点上、下游各500 kb区域内的基因,共找到771个基因。进一步分析与抗旱相关的基因,将第5号染色体上的DREB基因和EPF基因作为候选基因。
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