中药材黄连为毛茛科黄连属植物黄连Coptis chinensis Franch.及其同属植物的干燥根茎。《日本药局方》收载了日本黄连Coptis japonica Makino.,同时,各地还有多种栽培或野生黄连如三角叶黄连C.deltoidea C.Y.Cheng et Hsiao、云南黄连C.teetoides C.Y.Cheng、峨嵋野连C.omeiensis（Chen）C.Y.Cheng、西藏黄连C.teeta Wall.及线萼黄连C.linearisepala T.Z.Wang et C.k.hsieh等作为药用。 论文旨在通过随机扩增多态DNA（RAPD）技术,1)研究黄连属药用植物种间的遗传特征,鉴别该属植物,探讨物种间的亲缘关系,为黄连属药用植物的鉴定建立新方法,为形态分类提供分子水平的依据;2)研究川黄连种内遗传变异,为川黄连的道地性提供分子生物学依据;3)探索黄连属药用植物遗传特征与主要生物碱含量的关系。 采用星点设计法（CCD）优化RAPD-PCR反应体系,揭示RAPD-PCR反应体系中的Mg²⁺、dNTP、TaqDNA聚合酶、引物和模板DNA 5个重要因素之间存在交互作用,优化各因素后,建立的RAPD-PCR反应体系,其稳定性与重复性良好,适合用于黄连属药用植物RAPD扩增。 应用RAPD技术构建了黄连属药用植物DNA指纹图谱,采用数据分析软件计算了各种群的遗传距离和性状差异,构建了UPGMA聚类树,结果表明: 1)黄连属药用植物种间遗传多态性丰富,RAPD技术能有效用于该