【摘 要】
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蛋白质的稳定性随溶液环境的变化一直是人们关心的热点问题.近年来,用计算机模拟方法对包括水化作用在内的生物分子静电效应的研究取得了一些进展,但是仍缺少相对快速且有效
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蛋白质的稳定性随溶液环境的变化一直是人们关心的热点问题.近年来,用计算机模拟方法对包括水化作用在内的生物分子静电效应的研究取得了一些进展,但是仍缺少相对快速且有效的预测方法.针对这个问题,我们采用简单形式电荷模型来研究蛋白质二聚体静电相互作用,建立了一种快速、有效地预测蛋白质稳定性随溶液pH值和盐离子浓度变化的方法,并将其应用于蛋白质分子结构稳定性的分析和预测.以2Zn胰岛素和其速效突变体为研究对象,模拟结果与实验观测相符.我们的目的是通过分析蛋白质复合物的界面信息来拟合计算构象熵和结合自由能的简单有效的半经验模型.该论文在此分析了20组蛋白质二聚体分子的结合界面三个有效的参数信息.此外,我们还将界面信息描述的能量函数作为打分函数应用于蛋白质分子对接（Docking）和设计程序中.分子对接结果表明,此打分函数能有效并简单的应用于任意蛋白质分子对接.
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