论文部分内容阅读
第一部分:SATB1表达水平与乳腺癌临床病理特征的关系目的:利用免疫组化的方法检测SATB1蛋白在乳腺癌组织中的表达,并对SATB1表达水平与临床病理特征间的关系进行统计学分析,发现其相关性。方法:收集2001年1月到2003年12月,在广西医科大学附属肿瘤医院接受手术治疗的原发性乳腺癌组织蜡块292例,采用免疫组织化学方法检测患者肿瘤组织SATB1的表达情况,通过χ2检验分析SATB1表达水平与临床病理特征间的相关性。结果:最终纳入有效分析的病理蜡块数为208例。免疫组化结果显示,SATB1阴性有56例(26.9%),+有26例(12.5%),++为80例(38.5%),+++为46例(22.1%)。χ2检验显示,SATB1的表达水平与ER、PR、HER2及年龄之间没有统计学差异(p>0.05);而SATB1表达强度在(++)以上,与淋巴结状态,T分期之间具有显著相关性(p<0.05)。结论:SATB1的表达水平与激素受体状态、HER2表达及年龄之间无相关性,与淋巴结转移,T分期之间具有相关性。第二部分:利用生物信息学技术研究乳腺癌差异基因表达及其与SATB1基因的调控关系目的:利用生物信息学的方法筛选乳腺癌组织与癌旁组织间的差异表达基因,探讨这些基因与SATB1基因之间的表达及调控关系。方法:在GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中找到乳腺癌的相关基因芯片数据,利用BRB-ArrayTools软件包对其进行统计学分析,找到乳腺癌组织相关的差异表达基因;利用DAVID在线数据库对这些差异表达基因进行生物学分析。结果:在乳腺癌组织中找到70条差异表达基因,上调28条,下调42条。这些差异表达基因的功能大致分为:转录调控、细胞信号传导、细胞周期、细胞粘附、细胞凋亡等。与SATB1共同上调的基因主要为Collagen(胶原蛋白)基因家族; SATB1基因与其他共同上调基因之间未见相互调控关系。结论:利用生物信息学的方法成功的找到了与SATB1基因共同表达的基因群,为进一步了解SATB1基因与其共表达基因间的关系提供了前提。第三部分:SATBl基因克隆及pEGFP-N1-SATB1真核表达载体的构建目的:克隆扩增SATB1开放阅读框基因片段,构建其真核表达重组质粒,为后续研究其功能以及与其他基因间的关系做准备。方法:以SATB1基因的cDNA文库(pCMV6-XL6-SATB1)为模板,通过一对SATB1的特异性引物扩增出目的基因,PCR产物与克隆载体(pGEM-T-Easy)连接后转化到大肠杆菌DH5a,然后对单个菌落进行菌落PCR,酶切及测序鉴定。将测序正确的SATB1亚克隆入真核表达载pEGFP-N1,该重组载体转化到大肠杆菌DH5a后进行菌落PCR、酶切及测序鉴定。结果:测序结果与Genbank(BC001744.1)序列完全一致。构建的重组真核表达载体经鉴定证实SATB1基因已完全正确亚克隆到pEGFP-N1。结论:成功克隆了人核基质结合蛋白基因SATB1,并构建了具有报告基因-增强绿色荧光蛋白(EGFP)基因的重组真核表达裁pEGFP-N1-SATB1,为以后研究SATB1的功能以及与其他基因间的关系奠定基础。