基于阴道菌群构成变化的外阴阴道假丝酵母菌病复发风险预测模型构建

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研究背景外阴阴道假丝酵母菌病(Vulvovaginal candidiasis,VVC)是育龄期女性常见的下生殖道感染性疾病,与阴道菌群失调密切相关。VVC治疗后仍易复发甚至一年内复发4次或以上发展为复发性外阴阴道假丝酵母菌病(Recurrent vulvovaginal candidiasis,RVVC)。RVVC反复发作引起的临床症状及体征严重影响女性的身心健康、夫妻和谐与社会稳定,但目前其治疗仍是一难题。近年研究证实VVC患者阴道菌群构成呈多样化,RVVC相对单一;抗真菌治疗后,VVC患者阴道菌群结构的改变较RVVC显著,且后者菌群结构在疾病发作期和间歇期相似。亦有研究提示在VVC患者治疗后首次复发的阴道菌群较健康女性明显发生变化,随着复发次数增多其菌群结构则趋于稳定。本研究拟对VVC患者初次治疗后的阴道菌群状态与临床信息进行检测与分析,采用机器学习算法,构建VVC复发风险的预测模型,以期探讨和明确VVC复发的相关因素,为未来进行早期干预,预防其进展为RVVC打下理论基础。研究目的比较WC初治患者6个月内复发与未复发人群的阴道菌群差异,并基于VVC患者阴道菌群的构成,整合临床信息指标,尝试构建出VVC复发风险的预测模型。研究方法第一章2017年8月至2018年1月在云南省第一人民医院妇科门诊的首次诊断为VVC的患者,采集所有入组患者在初次治疗停药3天后复诊时的阴道分泌物。根据患者治疗后半年内的随访情况分为两组:复发组(即Yes)、未复发组(即No)。对样本进行处理后采用Illumina高通量测序技术对扩增的产物进行测序,再通过BIPES生物信息分析方法,比较两组间阴道菌群物种丰富度和结构差异。对多样性指数,应用SPSS20.0软件进行统计学处理,应用Wilcoxon Signed Ranks检验。P<0.05认为差异具有统计学意义。同时,我们采用LEfSe(LDA=2)在线统计分析工具寻找复发组与未复发组之间的差异菌属。第二章采用第一章入组患者分组方式及测序信息,并采用其初次就诊时所记录近1月内的相关临床信息,包括年龄、是否具有阴道冲洗习惯、避孕方式、性交方式、抗菌素的使用、激素的使用及首次发作时的VVC评分。同时运用机器学习法的随机森林预测模型分析菌属、临床信息与复发结局的关联,筛选出相关变量。随后将验证集合代入模型中,计算使得OOB(Out-of-bag)错误率达到最小值同时预测各变量的贡献值。最终通过得出预测模型及受试者的工作特征(Receivert Operating Characteristic curve,ROC)的曲线下面积(Area Under ther Curve,AUC)来评估模型的效能。研究结果第一章(1)初诊VVC患者初次治疗后阴道菌群以乳杆菌属为优势菌属,部分患者阴道菌群中还存在链球菌科、假单胞菌、加德纳菌属、普氏菌属、奇异菌属、达芬戈尔德菌等菌属。与未复发组相比,复发组在乳杆菌属,普氏菌属等有升高趋势,而在链球菌属、假单胞菌属、加德纳菌属及奇异菌属等有降低趋势。(2)两组间比较,复发组的菌群丰富度高于未复发组;复发组与未复发组菌群结构有所差异,且复发组的菌群结构更为稳定。(3)采用LEfSe分析寻两组间的差异菌属,发现在复发组中肠杆菌目、弧菌目、肠杆菌科、苯基杆菌丰富度增加;在未复发组中,红色杆菌目、紫单胞菌科、红蝽菌科、卟啉单胞菌属、螺杆菌属丰富度增加。第二章建立的预测模型在临床信息及菌群信息中筛选出与VVC复发风险相关的7个相关变量。将变量验证集纳入该模型的使得OOB错误率达到最小28.06%。同时根据计算出的贡献值对相关变量进行排序,阴道冲洗习惯是最重要的相关因素;卟啉单胞菌、奇异菌属、抗菌素的使用均与VVC复发风险呈负相关;金黄杆菌属、阴道冲洗习惯、年龄和激素的使用呈正相关。此外,通过得出预测模型及受试者的工作特征的曲线下面积为0.959,95%可信区间为(0.929-0.989),该模型预测效能位于可信区间中。研究结论VVC初治后的复发组阴道菌群丰富度更高,且菌群结构更趋于稳定。结合阴道菌群信息和临床信息可以成功建立VVC复发风险预测模型,并且预测效果良好。模型提示:阴道冲洗习惯是VVC复发最重要的因素;卟啉单胞菌、奇异菌属、抗菌素的使用是VVC复发风险的保护性因素;金黄杆菌属、阴道冲洗习惯、年龄和激素的使用是复发风险的危险因素。
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