解旋酶Pif1与DNA/RNA复合物的晶体学研究

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sky_ywt
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
Pif1家族是一种ATP依赖性的核酸解旋酶,包括酿酒酵母中的ScPif1、裂殖酵母中的SpPfh1、小鼠中的mPif1、人类中的hPif1等成员,能够结合和解旋G4结构、单链和双链DNA、DNA-RNA杂合链等核酸底物,在染色体稳定性、端粒代谢、基因的复制、线粒体的功能、基因的转录等方面具有重要的作用和生理功能。为了通过晶体学的方法研究Pif1家族及其复合物的结构,本研究使用大肠杆菌,克隆和表达了鼠源、酵母、人源等4种Pif1的全长或者截短后的蛋白。通过亲和层析和凝胶过滤层析等方法,纯化得到了mPif11-200,hPif1200-641,SpPfh1305-805,SpPfh1305-790,ScPIF140-859,ScPIF140-859-K264A等6个截短后Pif1蛋白,其中hPif1200-641具有较高的纯度,并且稳定均一,适于结晶。通过EMSA和Ge1 filtration等方法鉴定了hPif1200-641与不同核酸底物的结合效率,选择出最佳的DNA和RNA底物,纯化得到蛋白与核酸的复合物,进行共结晶。经过优化,得到蛋白hPif1200-641及其复合物的棒状单晶。其中hPif1200-641的蛋白晶体X衍射分辨率较高,可以达到3.5(A),属于P321空间群,晶胞参数为:a=b=204.4(A),c=77.93(A),α=90°,β=90°,γ=120°。该研究有助于阐明Pif1结合和解旋DNA和RNA的机制,为接下来的功能学研究奠定了坚实的基础,从而揭示其相关的的生理学功能及分子机理。
其他文献
蛋白质-DNA相互作用在众多生物学过程中都发挥着重要的作用,对于转录调控而言,蛋白质与DNA的互作则显得尤为重要,这是因为只有当转录因子精确结合目标DNA时调控才能正确起始。 
五氧化二氮(N2O5)是一种新型绿色硝化剂。电化学合成N2O5过程清洁、安全,符合绿色化学的要求,是最有工业化前景的方法,成为目前的主要研究方向。阳极材料是该过程的关键材料之一,其
缺铁性贫血是目前严重影响人类健康的疾病之一,它是由于体内贮存铁不能满足正常红细胞生成的需要而引发的贫血。据WHO报道,全世界已有超过20%的人群患有不同程度的贫血。传统的补铁剂有无机铁盐、有机铁盐、氨基酸螯合铁等,虽然它们的铁含量较高,但由于其对身体均存在不同程度的副作用,严重影响了铁的生物利用率。为了得到安全高效的补铁剂,本实验以生物相容性良好的类人胶原蛋白(HLC)为原料,通过巯基化改性,以F
水煤浆气化水系统是水煤浆气化工艺的重要组成部分,负责气化工序用水循环和回收,降低装置的耗水和废水排放量。该系统是否正常运行,关系到气化装置连续稳定高负荷运行,同时也
目的:  脯氨酰寡肽酶(POP)是一种特异性水解多肽链中脯氨酸残基羧基端肽键的丝氨酸蛋白酶,研究报道POP高表达于小鼠卵巢,但其在卵巢中的功能尚不清楚。本研究将探讨POP在小鼠
近年来,稻曲病的危害程度日益加重,已上升为水稻的一大主要病害,是由稻曲病菌(Ustilaginoidea virens)所引发。CYP51,即甾醇14α-去甲基化酶,是催化真菌麦角甾醇合成过程中的
作为一项工业技术,流化床目前在化工、农业、能源以及冶金等诸多领域得到了广泛应用。在化学工程领域,流态化现象多用于强化传热传质,亦可实现多相反应、产品加工乃至颗粒制造、