血清miRNA在慢性乙肝肝纤维化进展中的诊断价值

来源 :江苏大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:carlos_yu
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:本研究旨在寻找差异的血清miRNA在慢性乙肝肝纤维化进展中的表达及探讨其诊断价值。方法:本次研究共计分为三步,即发现,筛选和验证。在发现阶段中主要应用技术为新一代深度测序技术(Illumina Hiseq 2000),发现集样本经过总RNA提取及质检、文库构建、cDNA经纯化后在Illumina’s Cluster Station上生成DNA簇后上机(Illumina q2000)进行测序,对发现差异的miRNA通过筛选集qRT-PCR检测,miRNAs的表达水平由Ct值衡量。两组差异表达基因的比较用2-△△ct表示,并Logistic回归建立miRNA方程。利用验证集验证miRNA panel的诊断效应。病例来自于我院2017年1月1日至2019年1月30日慢性乙肝感染者进行肝穿刺病理检查的患者。共入选114例进行过肝穿刺慢性乙肝病例,43例正常对照组,对照人群来自我院体检中心的血清标本。发现集:健康对照3例(CN),轻度肝纤维化3例(MF),中重度肝纤维化3例(SF);筛选集:健康对照20例(CN),轻度肝纤维化20例(MF),中重度肝纤维化20例(SF);验证集:健康对照20例(CN),轻度肝纤维化36例(MF),中重度肝纤维化32例(SF)。结果:轻度肝纤维化组和中度以上肝纤维化组在病毒学指标方面无明显差异性。通过测序分析,对照组、慢性乙肝轻度、中度以上肝纤维化组经过初级分析后得到9739507,10031720和9990867条原始序列,经过去除冗余后剩余289819,469367和311364条可比对序列。对三组数据归一化后比较,在肝纤维化不同损伤,血清miRNA在CN和MF两者的表达差异,共发现84条有差异显著性的miRNAs,符合表达差异倍数4倍以上,P<0.05的8个miRNA为上调基因,18个下调miRNA表达基因。血清miRNA在MF和SF两者的表达差异,共发现124条有差异显著性的miRNAs,符合表达差异倍数4倍以上,P<0.05的15个miRNA为上调基因,13个下调miRNA表达基因。利用筛选样本集对上述表达差异的47个差异miRNA进一步筛选,筛选条件为:Ct值〈35,检测率〉75%,在CN和MF两者的表达差异,共筛选出4个候选miRNA,分别为:hsa-miR-34a-5p,hsa-miR-1228-3p,hsa-miR-122-5p和hsa-miR-26a-5p。在MF和SF两者的表达差异,共筛选出2个候选miRNA,hsa-miR-34a-5p和hsa-miR-337-5p。使用Logistic回归建立回归方程,MF区别健康对照组的Logit P1=-3.354+0.9354*miR34-0.3546*miR26a,我们将SF,MF视为独立变量,miRNA的循环数视为协变量,使用Logistic回归建立回归方程。SF区别MF的Logit P2=-4.235+1.2433*miR34a+0.5483*miR337。miRNA panel1(MF vs healthy)曲线下面积(AUC)为0.829(95%CI=0.705 to 0.917);敏感性=66.7%,特异性=90%,(P<0.0001)。miRNA panel2(SF vs MF)的AUC为0.663(95%CI=0.518 to 0.788);敏感性=50%,特异性=85%(P<0.05)。结论:miRNA在慢性乙肝肝纤维化进展中发挥重要作用,我们发现了miRNA在正常对照和慢性乙肝肝纤维化中表达差异,并且在肝纤维化的病情进展中仍然存在差异表达的miRNA。并且建立miRNA组合对肝纤维化的诊断具有一定价值。
其他文献
当今社会城市化水平不断提高,车辆的数目也随之迅速增长,大量的汽车进入人们的日常生活,同时也带来了交通拥堵、污染等问题。交通流预测作为智能交通管理系统的核心之一,不仅
半导体桥(SCB)是一种新型电火工品。其本身具有一定在电磁环境中的不发火能力,但在日益严苛的电磁环境和安全标准前,SCB火工品对电磁环境的防护能力仍需进一步提高。本文在对不同静电/射频防护器件的优缺点进行分析的基础上,选择同时使用TVS二极管和NTC热敏电阻对SCB火工品进行静电和射频的综合防护。对原有火工品结构进行重新设计,使其在保持体积不变的前提下可以集成TVS二极管和NTC热敏电阻。通过实验
铌酸锂晶体是一种性能优异的电光材料,基于铌酸锂电光效应制成的空间光调制器也一直是一个研究热点,它可以被用来调节光束的振幅以及相位,相较于传统的液晶空间光调制器,电光调制器有着更快的调制速度以及更大的光强承受能力。小规模、紧凑型的电光调制器在过去的数年之间已经快速的趋向于成熟,或许在不远的将来,它们会为在高性能计算,电子模拟电通信网络,以及数据中心中涉及到的相关应用带来较大的革新。本文在一开始概述了
重结晶碳化硅是重要的高性能结构陶瓷和耐火材料,具有优异的热稳定性、高温力学性能、耐磨性、耐腐蚀性等特点,是国防、冶金、耐火材料、车辆工程、陶瓷等行业的首选。重结晶
随着钢材市场竞争日趋激烈,首钢品种钢产量比例大幅度提升后,扩大品种向华中、西南地区推广销售为大势所趋。我国现有华中、西南地区品种钢主要由宝钢、武钢等企业供货。首钢
由于单个数据中心的资源有限,复杂的Spark工作流应用需要在多个数据中心内执行。当输入数据太大而无法传输(不可移动数据)时,依赖该数据的Task只能被分配在该数据所在的数据
氧化亚铜纳米颗粒(Cu2O NPs)作为一种价格低廉,环境友好,对可见光响应的P型半导体,在光催化领域备受关注。然而,受限于其光生电子-空穴分离效率低,纯Cu2O NPs的应用价值受到
模糊性是人类自然语言的本性特征之一。语言模糊性的重要体现形式在于模糊限制语的运用。因此,模糊限制语被认为是十分具有研究价值的模糊语言。以往学者在模糊限制语的研究中,主要关注学术论文的摘要、结论等部分。较少涉及对其引言的研究。通常,引言可以直接激发读者的阅读兴趣,阐明论文的相关研究和主旨。在与读者建立良好互动的过程中,发挥着重要的作用。因此,对论文引言中模糊限制语的研究,具有很重要的现实意义和研究价
在航空航天领域,精密仪器仪表需要在复杂温度变化下保持尺寸稳定性,需要低密度,近零膨胀材料。本文选用负热膨胀性能的反钙钛矿锰氮化合物,作为铝合金热膨胀系数抑制剂,成功
果糖催化脱水制备5-羟甲基糠醛(HMF)是生物质能源转化为液体燃料和高值化学品的关键技术之一。但是,该过程受到热力学平衡和副反应(HMF水合和分子间缩合)的限制,导致其产率较