本文采取相关知识回顾以及案例研究的方法对“我国校企合作创新中知识产权的分配机制”进行深层次的研究和着重解析，按照合作创新的发起方分类，将校企合作创新分为：企业主导模式、高校主导模式以及高校衍生企业三种。在现行法律的背景下，结合组织行为理论、分配理论、合约理论以及产权的评估定价，讨论合作发起的元要素对三种模式中产权归属、利益分配的影响。并且，对英国、美国、日本三个发达国家中校企合作创新中产权分配与管理做了梳理与总结。试图描绘我国校企合作创新的模式、结构，提炼出其特征，：国内校企合作知识产权分配的经验与存在的问题（1）不同模式下产权的分配情况差距很大；（2）多数情况下合作双方的利益目标不一致；（3）知识产权保护措施不完善。对国外校企合作创新中知识产权管理的经验进行提炼：（1）大学在校企合作创新中对产权的分配及收益有更大的权限；（2）政府的相关立法很大程度上为校企合作创新的知识产权分配提供了规范；（3）美国OTL知识产权经营模式大获成功。更进一步总结影响校企合作创新中知识产权分配的有关规律，并为我国校企合作创新在产权分配方面提出相关的政策建议：在与企业缔约时高校应强化知识产权保护意识；大力发展优势学科，增强自身科研水平；加强知识产权组织机构和管理制度建设，全面提升知识产权管理水平。企业方面，在平等互利的原则下为合作创新提供民主、法制的利益分配条件，建立优化的产权价值评估体系。政府更要增强立法、完善政策法规，为校企合作成果的产权分配制定规范，才能有利于校企合作创新的长久稳定发展。