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背景：基因诊断是孟德尔病确诊的金标准。在神经系统孟德尔病中,很多罕见的疾病突变形式复杂,或者具有明显的遗传和临床异质性,传统的基因检测手段（如Sanger测序等）由于检测技术和检测效率的限制,己难于满足当前分子遗传学领域高通量测序的发展要求。二代测序平台（NGS）的建立标志着测序技术己进入了高通量的新时代。NGS克服了Sanger测序在应用范围和应用成本上的种种不足,具有更高的性价比,具有很高的临床应用价值。目的：应用NGS对前期收集的8个神经系统罕见孟德尔病家系进行突变检测,从遗传学水平寻找致病突变；探讨NGS在罕见的神经系统孟德尔病基因诊断中的应用价值。方法：本研究对4个毛细血管扩张性共济失调（AT）家系、1个舞蹈病棘红细胞增多症（ChAc）家系和1个结节性硬化症（TS）家系的先证者应用靶向基因测序技术（TGS）进行测序,对发现的点突变应用Sanger测序进行验证,对发现的拷贝数变异（CNV）应用实时荧光定量PCR （qPCR）进行验证；对1个杆状体肌病（NM）家系和1个肢带型肌营养不良（LGMD）家系的先证者应用外显子组测序（WES）进行测序,对发现的点突变应用Sanger测序进行验证,并对上述发现的所有突变位点进行家系共分离分析。结果：本研究完成了上述家系的基因诊断,共发现了14个突变,其中：在AT家系中发现了致病基因ATM的4对复合杂合突变（c.5697C>A, exon65del; c.477481delATCTC, c.4777-2A>T; c.3078G>T, c.79837985delTGT; c.331+5G>A, c.14021403delAA）;在ChAc家系中发现了致病基因VPS13A的1个纯合突变（c.9403C>T）；在TS家系中发现了致病基因TSCl的1个新突变（c.3392T>G）；在NM家系中发现了致病基因NEB的1对复合杂合突变（c.24579G>A, c.9052G>A）；在LGMD家系中发现了致病基因CAPN3的1对复合杂合突变（c.2120A>G, c.20652066delAC）结论：本研究应用NGS技术完成了8个神经系统罕见孟德尔病家系的基因诊断；建立了基于NGS的神经系统罕见孟德尔病的基因诊断平台,提出了基于NGS的神经系统罕见孟德尔病的基因诊断策略。