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朊蛋白基因(Prnp)编码朊蛋白,是引起疯牛病的主效基因。为研究牦牛疯牛病的易感性与Prnp基因多态性的相关性,本文以288头牦牛为研究对象,鉴定牦牛的Prnp启动子23bp插入/缺失和第一内含子12bp插入/缺失多态,统计分析牦牛与各国已报道的牛23bp和12bp插入/缺失数据;并采用SYBR GreenⅠ荧光染料实时定量PCR方法对79头牦牛延髓组织中Prnp基因的mRNA表达水平进行了测定,并对不同单倍型、年龄、公母和毛色间的表达量进行了方差分析。结果表明:1.对牦牛Prnp基因23bp和12bp两个插入/缺失位点进行了鉴定和分析,得到牦牛23bp和12bp两个插入/缺失(I/D)位点的基因频率和基因型频率。其中,牦牛23bp插入-插入、插入-缺失和缺失-缺失基因型的频率分别为0.027、0.113和0.86,其插入和缺失等位基因的频率分别为0.133和0.867;12bp插入-插入、插入-缺失和缺失-缺失基因型的频率分别为0.627、0.355和0.018,其插入和缺失等位基因的频率分别为为0.804和0.196。与世界各国已报道的数据进行比较分析,牦牛12bp多态位点均具有较高的插入频率,而牦牛23bp多态位点具有极低的插入频率。2.构建了牦牛Prnp基因23bp和12bp插入/缺失位点组成的单倍型。牦牛以23缺失12插入单倍型(23D12I)为主,该单倍型频率为0.692。3.牦牛Prnp基因的相对表达量(延髓组织)在不同基因型中差异显著(P<0.05),验证了23bp和12bp插入/缺失多态影响牛疯牛病易感性。4.牦牛延髓组织中Prnp基因的相对表达量在不同年龄、性别和毛色中差异不显著(P>0.05)。本研究结果表明,牦牛朊蛋白基因23bp与12bp位点的插入与缺失影响该基因的相对表达,与资料数据相比较,这两个位点的突变影响牦牛疯牛病的易感性。