近年来随着我国经济高速发展,国家也逐渐开展更深层次的改革,着重强调反腐倡廉和权力约束机制,同时人民群众对社会公共服务的需求也日益多元化,这就要求作为提供公共服务行为主体的行政事业单位必须加强自身建设从而提升自己的管理水平来更好的响应国家号召,现如今,内部控制已经成为了行政事业单位日常管理的重要手段之一。行政事业单位的内部控制体系跟企业的内部控制体系相比来说起步较晚,存在理论与实践脱节的情况,对行政事业单位内部控制的理解也相对碎片化,并且我国现有的行政事业单位内控体系大多集中于宏观方向,缺少针对于不同行政事业单位的具体理论和具有实操性的具体措施。2020年突发疫情,公共卫生单位在抗击疫情中发挥了巨大的作用,由此再次进入人们视野并受到人们持续关注。公共卫生单位是行政事业单位的一种,承担着提供公共卫生服务,调配卫生资源等重要社会管理职能。与此同时,从21世纪开始国家大力发展该领域,城镇和乡村不断建立起配套的公共卫生组织单位,这些基层单位在疫情防控常态化的今天起着越来越重要的作用,但同时也暴露出管理以及业务方面的巨大风险和问题,公共卫生单位内部控制制度的完善可以提高资金的使用效率以及相关业务得有效运行率,同时可以大幅度降低运营风险,防止权力的滥用,使行政事业单位能够更好的提供公共服务。在此背景之下,本文以W卫生健康局为例,在《行政事业单位内部控制规范》的框架内针对内部控制存在的资金和业务等多个方面的问题进行分析和研究,从而提出具有实操性的有效对策,为我国的行政事业单位内控体系的构建提供案例资源。本文研究思路是:采用文献法和案例法相结合的方法,首先阐述现如今行政事业单位的内部控制体系研究的现状和制定的有关条文,再具体分析W卫生健康局的内部控制现状,针对问题提出具体的完善措施,同时总结具有普适性的行政事业单位的内部控制体系管理方法。