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目的:分析新疆某三甲医院的汉、维、哈族HCV感染者的病毒基因型,了解三个民族HCV感染主要基因型的差异。应用逆转录PCR扩增和反向点杂交技术进行HCV基因分型的检测方法,初步了解汉、维、哈族HCV感染者病毒基因型特点,为新疆地区HCV的基础研究、临床治疗和疾病预防提供依据。方法:收集2014年新疆某三甲医院诊断为丙型肝炎的汉、维、哈族感染者血清标本,先进行荧光定量PCR检测病毒载量,载量大于1×103 copies/ml的再用PCR-反向点杂交法进行HCV基因分型检测。结果:669份HCV感染血清样本PCR-反向点杂交基因分型成功652例,检出率为97.4%(652/669),检出6种基因型,分别为1b、2a、3a、3b、6a以及混合型1b/2a,其中1b型395例(60.58%),2a型188例(28.83%)。1b、2a型分布在汉、维、哈族之间有差异,且差异有统计学意义(P<0.05)。男性HCV感染者中2a型和女性HCV感染者中1b、2a型在汉、维、哈族构成比中有差异,且差异有统计学意义(P<0.05)。乌鲁木齐地区HCV感染者中,2a型在汉、维、哈族病例分布有差异,且差异有统计学意义(P<0.05)。其他地区HCV感染者中,1b、2a型在汉、维、哈族分布中有差异,且差异有统计学意义(P<0.05),在哈族病例中,1b、2a型所占比例较高,尤其是2a型,所占比例高于汉族、维族病例。1b型HCV感染者在各临床类型分布中有差异,且差异有统计学意义(P<0.05),丙肝相关肝癌中,1b型所占比例较高,达83.33%。1b型的平均RNA载量为(1.41×106±1.43×105)copies/ml,2a型的平均RNA载量为(7.84×105±1.43×105)copies/ml,两者差异有统计学意义(P<0.05)。载量水平(1.00×104~9.99×104)和(1.00×107~9.99×107),在1b、2a型和其他型之间有差异,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:新疆652例HCV感染者病毒基因型以1b型为主,其次是2a型,1b、2a型在汉、维、哈族丙型肝炎患者中存在差异。新疆的民族分布特征与其他北方内陆城市有一定差异,这可能是导致HCV基因型分布与以往报道的流行病学分布特征不一致的原因之一。6个基因型(1b,2a,3a,3b,6a,1b/2a型)在男女性别中的差异,各基因型构成均无性别差异。但按性别分层统计,结果显示,男女性丙肝感染者中,分别在2a型、1b、2a型中汉、维、哈族构成比有差异。这一差异可能与三个民族的生活习惯、受教育程度、贫富差距及种族基因型等因素有关。1b型HCV对肝脏的损伤要比其他亚型严重的多,且临床上其对干扰素的治疗方案和周期以及治疗效果也不尽相同。了解HCV基因分型区域分布特征具有很重要的临床及流行病学意义。对了解新疆地区丙型肝炎患者的HCV基因分型情况提供了重要资料,同时对于丙型病毒性肝炎的流行病学研究、判断病情和预后及观察抗病毒疗效提供了宝贵的资源。