【摘 要】
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水杨酸（salicylic acid,SA）是植物体内普遍存在的一种能够激活植物过敏反应（hypersensitive response,HR）和系统获得性抗性（systemic acquired resistance,SAR）的内源信号分子,在植物体内可转移并诱导植物抗性。明确茶树中与水杨酸相关的功能基因,对筛选高水杨酸的特异茶树资源,培育抗病虫害茶树品种具有重要意义。本研究以299份贵州地方茶
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水杨酸（salicylic acid,SA）是植物体内普遍存在的一种能够激活植物过敏反应（hypersensitive response,HR）和系统获得性抗性（systemic acquired resistance,SAR）的内源信号分子,在植物体内可转移并诱导植物抗性。明确茶树中与水杨酸相关的功能基因,对筛选高水杨酸的特异茶树资源,培育抗病虫害茶树品种具有重要意义。本研究以299份贵州地方茶树核心种质资源为材料,采用简化基因组测序技术（GBS）和高效液相色谱技术（HPLC）对299份贵州地方茶树核心种质群体进行基因内组测序和SA含量测定,开展贵州地方茶树核心种质资源的基因组和水杨酸表型的全基因组关联分析（GWAS）。结果如下:（1）水杨酸含量表型统计分析显示,环境一的贵州地方茶树核心种质群体水杨酸含量偏度为-0.2590、峰度为-0.4360;环境二的贵州地方茶树核心种质群体水杨酸含量偏度为-0.3460、峰度为-0.3390。（2）通过群体结构分析,299份贵州地方茶树核心种质资源被分为5个亚群,其中Q1亚群包含有16份材料中50%的为栽培型、50%为野生型;Q2亚群有26份材料,大部分为栽培型的现代地方品的茶群体;Q3亚群有13份材料,大部分为野生型的大厂茶群体;Q4亚群有106份材料,大部分为栽培型的古代地方品种;Q5亚群有138份材料。（3）对5个推断群体的核苷酸多态性（π）、观测杂合度HO、Tajima’D分析,结果显示,5个亚群中Q1、Q2、Q3、Q4和Q5推断群体的平均观测杂合度（HO）分别为0.0596、0.0684、0.0462、0.0732和0.0842;Q1、Q2、Q3、Q4和Q5的Tajima’D分别为0.2130、0.2130、0.5639、0.3479和0.6385;Q1、Q2、Q3、Q4和Q5的核苷酸多态性（π）值分别0.1742、0.1519、0.1046、0.1925和0.2282。其中Q5亚群遗传多样性最大,其次是Q4亚群。（4）对5个推断群体的分化系数（Fst）分析显示,Q1亚群与Q3亚群之间的Fst值最大为0.2059,与Q5亚群间的Fst最小为0.0383;Q2亚群与Q3亚群间的Fst值最大为0.2714,与Q5亚群间的Fst值最小为0.0543;Q3亚群与Q2亚群间的Fst值最大为0.2714,与Q5亚群间的Fst值最小为0.1099;Q4亚群与Q3亚群间的Fst值最大为0.2287,与Q5亚群间的Fst最小为0.0361;Q5亚群与Q3亚群间的Fst值最大为0.1099,与Q4亚群间的Fst值最小为0.0361。（5）以GLMP=SNP+P、CMLMQ+K、GLMQ=SNP+Q、MLMP+K=SNP+P+K、MLMQ+K=SNP+Q+K和CMLMP+K等6种模型对贵州地方茶树核心种质群体水杨酸表型性状的全基因组关联分析,以-lgp>5为显著关联阈值,结果显示,共关联到22个显著关联的SNP位点,其中位于11号染色体上的有6个SNP位点、15号染色体上有3个SNP位点;2号染色体上有2个SNP位点;3号染色体上有2个SNP位点;SCONTIG592号染色体上有2个SNP位点;5、7、8、12、13、14、15号染色体上均为1个SNP位点。在关联到的位点中,位点S3-99765286在GLMQ、GLMP、MLMQ+K、MLMP+K等4种模型中均被关联到,位点S3-99765348在GLMQ、GLMP、MLMP+K等3种模型中均可关联到,位点S12-53708322、S11-93067916在GLMP、GLMP+K等2种模型中被关联到。（6）LD分析显示贵州地方茶树核心种质群体半衰减距离为15kb,在关联到的22个SNP位点15kb范围内,共找到有8个基因,分别为CSS0033791、CSS0037650、CSS0035116、CSS0017205、CSS0040476、CSS0032908、CSS0042839、CSS0011624。其中基因CSS0033791、CSS0042839可能与茶树中水杨酸的调控有关。
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