《“十二五”国家战略性新兴产业发展规划》将战略性新兴产业作为我国经济今后发展的先导产业和支柱产业。地方政府如何有效的支配财政支出，支持地方战略性新兴产业的发展已成为亟待解决的重要问题。而民族地区，存在文化差异大、经济发展水平较慢、自然资源丰富等特点，虽然有发展战略性新兴产业的优势，但却受经济、科技等条件限制，发展缓慢。因此本文着力研究民族地区战略性新兴产业的财政支出效率问题，把定量分析和定性分析相结合，从政府的角度构建模型，主要考虑财政支出对民族地区经济、社会和环境方面的影响作为参考指标，运用DEA数据包络分析方法中C2R模型原理，计算出包括内蒙古、宁夏、四川、青海、湖南、贵州、云南、广西、海南、等10个民族地区的规模效应，在对结果进行分析的基础上，得到以下结论：在不剔除环境因素和随机误差的情况下，2011年我国民族地方政府支出规模效率的均值为0.416；2013年我国民族地方政府支出规模效率的均值为0.288。从整体来看，这10个省份财政支出在新兴产业方面的效率都不高。局部来看只有甘肃省的规模效益是1，其中内蒙古、四川、贵州、海南、云南2013年的规模效益较2011年有所下降，尤其是云南下降的幅度非常大；其它五个省份都有不同程度的提高，这之中以广西的规模效益提高最好，青海基本保持不变。最后，根据数据结果以及我国民族地区战略新兴产业的发展实际，本文从政府财政支出、财政支出绩效评价等角度，提出优化民族地区财政对于战略性新兴产业的长效投入机制、健全民族地区政府财政支出绩效评价制度、强化民族地区战略性新兴产业财政支出监督考核机制、加强民族地区财政支出政策改革等4项可供参考的对策建议。