EGFR基因突变检测方法及MazF蛋白表达系统的建立

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表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)是一种多功能的糖蛋白,是ErbB家族成员之一,其与肿瘤增殖、血管生成、肿瘤转移和抗细胞凋亡有关。许多癌症患者体内均发现EGFR基因的高表达或者过表达。随着分子生物学的发展,在非小细胞肺癌治疗方面,靶向药物治疗已经取得了很大的进展。有研究发现,酪氨酸激酶域发生突变的EFGR对吉非替尼等一类酪氨酸激酶抑制剂具有更强的敏感性。因此,对患者体内EGFR的突变状态进行检测可更有针对性地实施治疗方案。目前对于EGFR突变检测的平台有很多,公认的“金标准”—直接测序、限制性片段长度多态性(Restriction Fragment LengthPolymorphism,RFLP)、免疫组织化学技术(Immunohistochemistry, IHC)、实时定量PCR(Real-time Quantitative Polymerase Chain Reaction, Real-Time PCR)、变性高效液相色谱(Denaturing High-performance Liquid Chromatography,DHPLC)等。但现有的检测平台都有自身的缺陷,因此,建立一种特异性强、灵敏度高的EGFR突变检测方法是十分有必要的。  在本研究中,针对9种EGFR内部常见的突变类型,采用以常规聚合酶链式反应为基础,结合双脱氧修饰引物以及高保真聚合酶的模式,建立了一种新的检测EGFR突变的方法。首先,通过基因工程构建了野生型质粒和突变型质粒;其次,用正交实验优化该实验的反应体系,最终确定各个突变位点的最优检测体系;再次,对野生型质粒和突变型质粒进行一系列的稀释,对其进行检测,以确定该实验方法的检测下限,结果显示该方法最低检测下限为102 copies/μL。同时,将EGFR突变型细胞H1975(内含T790M突变)和H1650(内含E746_ A750del突变)的基因组DNA进行等比混合,用各自的最优检测体系进行检测,结果显示该方法的最低选择性能力为0.5%。最后,我们用建立的新方法对肺癌血液样品进行检测,结果显示样品26号和样品33号有L858R突变,然后将这两个样品送到生物公司进行Sanger测序,结果一致,说明该方法可靠。  艾滋病是世界公认的医学难题,根据艾滋病规划署提供的数字,2012年全球死于艾滋病的人数有160万,因此,对艾滋病治疗的研究迫在眉睫。毒素-抗毒素系统中的MazF毒素蛋白是一种序列特异性内切酶,可以特异性地切割mRNA上的ACA位点。HIV-1基因组的RNA有超过240个ACA位点,因此,考虑毒素蛋白MazF对HIV-1进行切割以达到抑制HIV-1的增殖是一个潜在的候选的方案。本研究构建了一个Tat依赖的MazF蛋白真核表达系统,首先,对mazF基因序列进行同义突变;其次,通过基因工程构建pcDNA3.1-U3TAR-mazF-HA-GFP(-)真核表达质粒;然后将该质粒与pcDNA3.1-tat-flag共转染HEK293T细胞,通过荧光和Western Blotting分析,结果显示Tat蛋白可以启动MazF蛋白的表达。
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