长链非编码RNA HOTAIR, PRNCR1单核苷酸多态性与胃癌相关性的研究

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目的:胃癌(Gastric cancer GC)的形成是一个多基因参与的过程。研究表明,长链非编码RNA(Long non-coding RNA,LncRNA)HOTAI R、PRCNR1与肿瘤的发生发展密切相关。SNP作为最常见的基因变异普遍存在于lncRNA中,因此,本实验旨在研究HOTAIR,PRCNR1的SNP与胃癌易感性的关系,为今后胃癌的风险预测和早期诊断提供新的思路。方法:本研究共收集92例胃癌患者血标本及56例健康对照血标本,同时收集病例性别、年龄、肿瘤部位、分化程度等信息。提取两组全血DNA。查阅文献确定两个与肿瘤明确相关的SNP位点作为研究对象,探讨其与胃癌的关系,两位点分别位于长链非编码RNA HOTAIR和PRNCR1。根据SNP所在序列设计目的片段引物,PCR扩增SNP所在的目的片段。通过连接酶检测反应(LDR)技术检测目的片段基因型。应用SPSS 21.0统计软件进行数据分析。P<0.05表示差异有显著性。结果:1.胃癌组与对照组的性别、年龄无明显统计学差异。2.先随机选取胃癌病例组41例,对照组56例,对两组样本多态性位点HOTAIR rs2366152和PRNCR1 rs7463708进行扩增、测序。结果经卡方检验不能认为rs2366152两组间各等位基因频率有统计学差异(P=0.507);rs7463708两组间各基因型频率有统计学差异(P=0.046),于是对rs7463708位点扩大样本量研究。3.PRNCR1 rs7463708病例组扩大样本后最终有胃癌组92例,对照组56例被纳入研究。两组间各基因型频率有统计学差异(P=0.009),分析发现携带基因型GT的个体较携带基因型GG的个体患胃癌的风险下降71.3%(Padjusted=0.024);携带基因型TT的个体患胃癌的风险下降76.1%(Padjusted=0.011);携带基因型GT/TT基因型较携带基因型GG患胃癌的风险下降73.6%(Padjusted=0.011)。同时,携带等位基因T较等位基因G患胃癌的风险降低47.3%(P=0.010)。对照组Hardy-Weinberg平衡检验P>0.05(P=0.502)。经分层分析,结果显示rs7463708突变降低胃癌风险与年龄、不同肿瘤位置、分化程度、TNM分期均存在关联性。携带GT/TT基因型的个体较GG型者:年轻个体(≤60岁)患胃癌风险下降85.7%。近端胃癌的风险下降74.4%(Padjusted=0.041);患远端胃癌的风险下降73.9%(Padjusted=0.014);低分化胃癌的风险下降78.5%(Padjusted=0.005);患Ⅲ-Ⅳ期胃癌的风险下降74.4%(Padjusted=0.013)。结论:1.PRNCR1 rs7463708胃癌组与对照组间各基因型频率有统计学差异,携带等位基因T是胃癌的保护性因素。2.尚不能认为HOTAIR rs2366152单核苷酸多态性与胃癌风险相关。
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