我国的保税区发展至今已有二十多年的历史，但并未接轨国际通行的自由贸易区，中国（上海）自由贸易试验区的设立主要是为建设符合国际惯例的自由贸易区探索适合推广的新模式。但我国保税区的发起设立属于地方政府行为，在研究保税区向国际通行自由贸易区发展问题时应该因地制宜，不仅对我国保税区发展中存在的共性问题进行分析，更应该针对具体的保税区进行个案分析。基于我国保税区与国外自由贸易区的比较分析，本文认为两者的差距主要体现在管理体制、体制政策和运行政策三个方面，并总结了应实施高效管理、提供法制保障和实现真正的“境内关外”三点启示。本文选取张家港保税区为研究对象，采用SWOT分析法对其发展的内外部环境进行分析，得出结论：张家港保税区向国际通行自由贸易区发展中机遇和挑战并存，虽已具备了优越的港口区位条件，宽阔的经济腹地支撑，发达的临港产业基础等有利条件，但仍存在岸线资源匮乏，与周边区域联动不足，土地资源紧张，创新研发能力较弱等制约因素。在自由贸易区视角下，本着“先行先试，逐步推进”的原则，强调张家港保税区应建立健全法律制度保障，改革保税区的管理体制；创新海关监管服务模式，实现真正的“境内关外”；坚持先规划后建设原则，提高土地资源使用效率；加快岸线资源整合利用，强化与周边区域联动；培育战略性新兴产业，健全产学研合作体系；实现专业市场双轮驱动，与上海自贸试验区错位发展，加速接轨国际通行自由贸易区。