荧光定量PCR检测婴儿配方奶粉中阪崎肠杆菌研究

来源 :河北农业大学 | 被引量 : 10次 | 上传用户:wangcongyu003
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阪崎肠杆菌能引起严重的新生儿脑膜炎、菌血症、小肠结肠炎,并可能引起神经功能紊乱,造成严重的后遗症,死亡率高达20%~50%以上,引起世界范围内的广泛关注。通过研究发现婴儿配方奶粉是其主要的感染源。传统方法(FDA推荐)操作繁琐,检测时间长,且灵敏度较低。本研究利用荧光定量PCR技术建立了一套从婴儿配方奶粉中快速检出阪崎肠杆菌的方法,缩短了阪崎肠杆菌的检测时间,提高了灵敏度。本研究以阪崎肠杆菌的16S rRNA基因为靶基因,选择特异性引物和探针,经过普通PCR扩增后,将PCR产物进行1%的琼脂糖凝胶电泳,产物胶回收纯化后连接到pMD18-T载体上,并转化至大肠杆菌JM109感受态细胞中,对阳性克隆进行了筛选鉴定,构建了目的重组质粒,作为标准品绘制标准曲线。并对插入的外源基因进行了测序,与文献报道的序列相似性达到100%,从而证实PCR扩增产物确为目的扩增产物。本研究还用相同的方法设计并构建了内标重组质粒和内标探针,它与目的基因在同一反应体系内同时扩增。构建的内标重组质粒可以得到较好的扩增曲线和Ct值,可以避免假阴性的产生,确保实验的可靠性。对PCR反应体系中退火温度、引物探针配比、内标浓度进行了优化,以确定适宜PCR反应体系和PCR扩增程序。适宜反应体系为:12.5μL Premix Ex Taq(2×),上、下游引物(各10μM)各0.5μL,1μL目的探针(3μM),1μL内标探针(3μM),1μL.内标重组质粒DNA(10~4 copies/μL),1μL目的重组质粒DNA,8μL灭菌双蒸水,总反应体系25μL;适宜扩增程序为:95℃预变性10S,再按94℃5S—60℃20S进行45个循环。本研究共检测了15株菌,4株阪崎肠杆菌中均为阳性结果;11株其它肠杆菌均为阴性结果。因此本研究用到的引物、探针特异性较强。结合mLST-BHI两步法增菌,比较了3种从婴儿配方奶粉中提取阪崎肠杆菌DNA的方法,结果表明试剂盒法可从样品中高效提取阪崎肠杆菌DNA作为模板进行检测,且无论检测时间及灵敏度均明显优于其他方法。本方法纯菌培养物检测灵敏度可以达到8.624拷贝/μL,2.7CFU/mL;人工污染检测限可以达到14.117拷贝/μL,3.5cfu/100g婴儿配方奶粉,并且使检测可以在1个工作日内完成,大大缩短了检测时间。对实际样品进行检测,将荧光定量PCR方法与行业标准SN/T 1632.1-2005方法进行比较,确定荧光定量PCR方法敏感性为100%;特异性为99.0%;符合率为99.0%。
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