毛尖紫萼藓GH394基因生物信息学分析及克隆、表达载体构建

来源 :齐齐哈尔大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:maxzhk
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苔藓植物是自然环境中的拓荒者之一[1]。现阶段对耐旱藓类的相关研究以及基因功能的研究和阐述并不详尽。本研究的目的基因GH394选自本实验室应用SMART技术构建的毛尖紫萼藓(Grimmia pilifera P. Beauv)干旱胁迫cDNA文库。经Blast比对,与谷胱甘肽-S-转移酶(GST)序列相似度达89%,初步断定GH394基因为毛尖紫萼藓抗旱相关基因。根据NCBI中已报道的GST序列设计引物,研究通过GH394基因的获得及构建克隆、表达载体,为后续的基因真核表达、基因功能验证奠定了良好的实验基础。本研究的方法及研究结果如下:1.利用改良的SDS法提取材料总RNA。得到清晰的18S、28S RNA条带,利用NanoDrop2000测定,OD260/280在1.8-2.0间,符合实验要求。2.通过3′-RACE获得基因的全长序列,并根据NCBI中已报道的GST序列设计特异引物,利用DNAMAN6.0对GH394基因序列进行酶切分析,确定该基因的可插入位点BamHⅠ和SacⅠ。将材料总RNA反转录为单链cDNA,并以单链cDNA为模板进行引物PCR。得到清晰条带,位置与预期657bp大小相符,回收目的条带。3.利用生物信息学相关软件对其:ORF、蛋白理化性质、氨基酸的三维结构、二级结构、基因家族等进行了分析。4.将回收的目的片段与pMD18-T Vector进行连接,产物转化大肠杆菌(Escherichiacoli) DH5α,检菌、测序,提取质粒进行双酶切。回收目的片段。5.对载体pRI101-AN进行双酶切,回收大片段。利用T4连接酶将目的片段和载体大片段连接起来,产物转化大肠杆菌进行修复,再转入根癌农杆菌(Agrobacteriumtumefaciens)GV3101中,检菌,通过质粒PCR进行鉴定。通过测序结果和电泳、酶切图像表明,已成功构建了pMD-GH394克隆载体和pRI101-AN-GH394表达载体并将重组质粒载转入目的菌株中。
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