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本文将11份农艺性状差异较大的甜玉米自交系按NCⅡ不完全双列杂交设计，配成30个杂交组合。分别利用形态学标记和SSR分子标记对11份甜玉米自交系进行遗传距离的分析，并且划分甜玉米自交系杂种优势群；利用自交系及F1代获得的试验数据分析了12个性状的平均优势和超亲优势；将遗传距离与杂种优势的结果比较分析，对甜玉米遗传距离与杂种优势的关系进行研究，试验结果如下：（1）农艺性状遗传距离与聚类分析：12个性状F测验均达到极显著水平，说明11份甜玉米自交系间的12个性状存在极显著差异；11份甜玉米自交系以遗传距离3.69为标准，分为四类，第Ⅰ类包括6个自交系，分布在三个亚群中，第Ⅰ1亚群包括：M1，F1，第Ⅰ2亚群包括M6，F3，F4；第Ⅰ3亚群包括M4；第Ⅱ类仅有一个自交系M3；第Ⅲ类包括2个自交系：M5，M2；第Ⅳ类包括2个自交系：M2，F5。（2）SSR分子标记遗传距离和聚类分析：分布在10对染色体上的20对核心引物在11份甜玉米自交系上共检测出71个等位基因变异，每对引物检测出2-6个等位基因，平均为3.55个；11份甜玉米自交系遗传距离变化范围为0.3636—0.9143，平均值为0.77。本试验30个杂交组合中，M2与F1之间遗传距离最大，其遗传距离是0.9143；M6与F4之间遗传距离最小，其遗传距离仅为0.3636；以遗传距离0.76为标准，将11份甜玉米自交系划分成4个类群。第一类群有2个甜玉米自交系，包括：M1、F1；第二类群有2个甜玉米自交系，包括：M2、F5；第三类群有4个甜玉米自交系，分布于2个亚群，第Ⅲ1亚群包括M3、M4，第Ⅲ2亚群包括M5、F2；第四类群有3个甜玉米自交系，分布于2个亚群，第Ⅳ1亚群包括M6、F4，第Ⅳ2亚群包括F3。（3）杂种优势及方差分析：30个杂交组合各性状平均值均优于亲本。F1代各性状变化幅度均大于亲本的变化幅度；通过对甜玉米F1代的杂种优势分析，全部性状平均优势和超亲优势都是正向优势多于负向优势；本试验中存在一批优势组合：M1×F5、M4×F3、M5×F5、M5×F1和M2×F2，各组合产量性状等都有着较强的杂种优势；各性状杂种优势指数平均值大小为：小区产量>单穗重>行粒数>秃尖长>百粒重>穗长>穗位>株高>穗粗>茎粗>穗行数>可溶性总糖。说明小区产量、单穗重、行粒数、秃尖长、百粒重等性状在以后育种工作中选择余地较大，可溶性总糖、穗行数、茎粗等性状的杂种优势指数较低，选择余地相对较小；对30个杂交组合的12个性状采用不完全双列杂交法进行方差分析，结果表明，各组合间差异均达到极显著水平，说明各性状在组合间存在着真实的、由基因型引起的可遗传差异。（4）遗传距离和杂种优势的关系：甜玉米自交系数量性状遗传距离与杂种F1代茎粗、穗位高、穗粗三个性状的杂种优势指数呈极显著正相关，与株高、穗长、穗行数和小区产量呈显著正相关；SSR标记遗传距离与杂种F1代的株高和茎粗两个性状的杂种优势指数呈极显著正相关，与秃尖长呈显著负相关；本试验中杂种优势较强的杂交组合其亲本大多数都来自于不同类群，亲本遗传距离小的杂交组合大多数杂种优势较弱。，自交系间遗传距离与杂交组合小区产量性状并不成简单线性关系。