重症肺结核学免疫特性研究

来源 :中国人民解放军医学院 | 被引量 : 2次 | 上传用户:fine_yhy
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目的1.应用转录组学技术系统研究重症肺结核与轻症肺结核患者基因表达差异及其与疾病预后的关系。2.研究重症肺结核患者免疫应答的特征及免疫机制,发现重症肺结核病人免疫病理可能的分子基础,为重症肺结核患者免疫台疗研究奠定基础。方法1.确定患者入选标准和剔除标准。2.标本采集:收集解放军309医院结核病研究所住院患者及正常对照组外周血标本,分离单个核细胞,用Trizol裂解后冻存,送博奥公司做基因芯片表达谱分析。3.基因表达谱芯片检测结果的数据分析和生物信息学分析。使用Cluster聚类分析软件、SAM软件、MAS分子注释系统对芯片结果进行聚类分析、差异基因筛选、差异基因的GO注释和Pathway分析。4.表达谱分析结果的验证。按照入选标准再次收集病例与正常对照标本。用RT-PCR和ELISA方法验证芯片结果。5.统计方法:用方差分析做数据方差齐性检验,用非参数检验做组间比较。结果1.基因表达谱芯片Cluster聚类分析显示重症与轻症肺结核病人、正常对照组相比有明显的表达差异基因。2.用SAM软件筛选差异表达基因,按照p<0.05,比值≥2或≤0.5的标准,分组筛选结果显示:轻症与正常组相比下调基因12条;重症与正常相比上调基因317条,下调基因350条;重症与轻症相比上调基因142条,下调基因263条。3.MAS分子功能注释系统做GO注释显示差异表达基因主要涉及生物学过程。Pathway分析显示重症肺结核病人的差异表达基因参与有统计学意义(p<0.05)的信号通路共35条,主要涉及免疫反应、炎症反应、组织损伤和重构、凋亡与杀菌、物质代谢等通路。4.对候选基因用RT-PCR验证芯片结果显示:CCL3、IL-1β、c-Jun和CXCL2在重症肺结核病人表达下调,统计学有显著性差异(p<0.05),与芯片结果符合;用ELISA验证结果显示CCL4和IL-1β表达下调,统计学有显著性差异(p<0.05),与芯片结果符合;用ELISA验证c-Jun的蛋白表达量结果显示重症病人表达下调,统计学有显著性差异(p<0.05)。结论重症肺结核病人与轻症肺结核及正常健康人相比,有大量差异表达基因,涉及复杂的炎症和免疫反应信号通路网络,其严重的肺部病理损害有相应分子生物学基础。
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