受国际民族主义运动的影响,我国的民族问题研究也呈现热点纷呈之势,2008年达赖集团等“藏独”分子在拉萨的暴力破坏、2009年乌鲁木齐的七五暴力事件等等就是明证。在现实生活中,民族问题与经济问题、宗教问题、历史问题、政治问题相互交织。新疆南疆三地州是维吾尔族的主要聚居区域,也是新疆各种经济文化交融的地区。在民族意识和民族利益诉求不断高涨的情势下,如何在民族认同的基础上形成更高层次的国家认同、国家认同与民族认同如何利于区域治理的顺利开展、认同感如何促进边疆地区的团结与稳定?因此,对新疆南疆地区维吾尔族展开认同研究也因此显得至关重要。文章主要采用采用规范分析与实证分析相结合的方法,从认同的角度分析民族认同与国家认同对边疆的区域治理产生的作用。并相对完整地概括了民族认同与国家认同的概念、条件、特征以及相互之间的关系,较系统地探讨新疆南疆地区的地理条件、经济条件、宗教文化对当地的影响、少数民族的自身认同与国家认同状况,以及民族认同高于国家认同作用下产生的各种矛盾问题。探讨南疆地区维吾尔族的认同状况和高度的国家认同对该区域治理的意义。最后提出强化南疆维吾尔族国家认同的对策,为边疆地区区域治理提供一定参考,促进新疆南疆地区的稳定与团结发展。本文认为,少数民族地区的民族认同与国家认同并不总是一致,他们之间存在着张力甚至冲突,现代化过程给相对较为传统封闭的少数民族地区带来的种种震荡和变化,产生了民族认同与国家认同之间的矛盾,有的地区甚至严重影响着少数民族已有的国家认同。对于一个多民族国家来说,如果国内各民族的矛盾和冲突得到协调,国家就可以通过内部的积极整合增强民族凝聚力和向心力,促进国家经济、文化的蓬勃发展。反之,若国内民族矛盾或冲突激化,就会演化为公开的政治冲突和分裂运动。民族认同和国家认同对于少数民族地区的影响意义,对于身处少数民族地区的作者来说有深刻感受,但从专业的角度出发,我们不仅要有民族感性的一面,还应该具有更高层次的人文关怀,从人性角度,对民族认同做理性的思考,从民族、政治、区域的角度,对南疆地区发展目标进行价值考量。我国是一个统一的多民族国家,在长期的历史发展中各个民族的内部认同在不断发展,国家认同却不是一帆风顺的。目前世界许多国家至今未息的民族间的冲突和战争,拉萨、新疆等地区的暴力和民族分裂活动,使我更为深切地感受到生活在一个和平、和睦、和谐的国家里是多么幸福。