应用基因表达谱芯片筛选IgA肾病患者肾穿组织相关基因的研究

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目的:本文试图利用Agilent公司的基因表达谱芯片对IgA肾病患者肾穿组织的表达谱和正常人肾脏组织的表达谱进行研究,筛查IgA肾病组织标本的差异表达基因,为IgA肾病临床诊断芯片的开发提供数据基础,为IgA肾病的临床诊断和治疗提供新的途径。并验证基因表达谱芯片筛查IgA肾病基因的可靠性。方法:收集3例IgA肾病肾穿组织标本和1例尸肾组织标本,应用RNAwait低温保存后提取总RNA,分别标记荧光探针后与含22575个基因的Agilent Human 1A oligo基因表达谱芯片杂交。杂交后进行图像扫描和数据分析。并使用real-time PCR对部分筛查结果进行验证。结果:3例IgA肾病中共同表达的差异基因215条,涉及疾病发生发展的各个方面。其中表达上调的基因52条,表达下调的基因163条。其中:蛋白结合基因52条;细胞凋亡或肿瘤相关基因36条;代谢相关基因28条;细胞信号和传递蛋白21条;细胞周期蛋白17条;转录调控蛋白11条;物质运输蛋白11条;其他39条。选取其中14条基因利用Real-time PCR进行扩增,结果证实所选基因在IgA肾病中均有异常表达,与基因芯片的表达情况一致。结论:应用基因表达谱芯片筛选IgA肾病的差异表达基因是可行的,基因芯片技术能够低消耗、高灵敏度、高通量地分析细胞内基因的表达谱。通过IgA肾病与肾脏正常组织之间大量的差异表达基因的比较分析,发现了许多新的差异表达的基因。验证结果显示表达谱基因芯片筛查基因表达异常是可靠的。
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