【摘 要】
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研究背景和目的:肺癌是导致癌症相关死亡的主要原因[1],非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)是其主要类型,约占肺癌的85%。NSCLC包括腺癌(adenocarcinoma,ADC)、鳞状细胞癌(squamous cell carcinoma,SCC)、大细胞肺癌等[2]。有关肺癌病因学的研究已经证实,吸烟、二手烟、大麻、职业接触、非感染性呼吸道疾病史、
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研究背景和目的:肺癌是导致癌症相关死亡的主要原因[1],非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)是其主要类型,约占肺癌的85%。NSCLC包括腺癌(adenocarcinoma,ADC)、鳞状细胞癌(squamous cell carcinoma,SCC)、大细胞肺癌等[2]。有关肺癌病因学的研究已经证实,吸烟、二手烟、大麻、职业接触、非感染性呼吸道疾病史、遗传基因等与肺癌的发生有着密切的关系[3]。其中遗传基因是我们不能忽视的一个重要原因。单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是最常见的遗传变异类型,是指由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列的多态性。SNP可导致个体间对肺癌的易感性以及肺癌的临床病理特征出现差异,但其机制仍未阐明。本研究拟探讨CDH1、FANCB和APC基因SNP与肺癌遗传易感性的关系。同时在得出FANCB基因rs754552650位点能显著降低肺腺癌的发生率这一结论后,查阅相关文献,发现该基因在范可尼贫血研究报道较多,但在肺癌中暂无相关文献报道,因此我们进一步研究FANCB基因与肺腺癌的关系。方法:采用病例对照研究方法,收集来自天津医科大学总医院肺部肿瘤外科270例肺癌病例,同时收集445名健康志愿者的血液样本作为对照,并提取基因组DNA,使用Taqman?SNP基因分型试剂盒进行基因分型,分析CDH1基因rs201141645、FANCB基因rs754552650和APC基因rs149353082三个SNPs位点在中国人群中的分布。探索不同基因型与肺癌发病风险之间的关系,采用卡方检验和Logistic回归分析。进一步采用生物信息学及肺腺癌细胞系PC9和H1975两个细胞株用于后续体外实验。利用si RNA转染技术敲低FANCB表达,并经RT-q PCR确认后,使用cck8、Edu、集落形成实验对敲低FANCB之后的肺腺癌细胞的生长能力进行测定,同时使用Transwell实验检测敲低FANCB之后的肺腺癌细胞的迁移侵袭能力的影响。结果:FANCB基因rs754552650位点的AA、A/G和GG基因型的分布频率在对照组中分别为27.2%、52.6%和20.2%。AA和A/G基因型分布频率在病例组中分别为93.7%、6.3%,未检测到GG基因型。FANCB基因的rs754552650位点的A/G基因型在病例组和对照组中存在显著差异。携带者患肺癌的风险明显降低(OR=0.035,95%CI:0.020-0.062,P<0.001)。CDH1基因rs201141645 A/C和CC基因型仅存在于对照组中。此外,在病例组中仅发现1个样本存在APC基因rs149353082 C/G基因型。我们经TCGA数据库下载了经统一标准化的泛癌数据集,进一步的我们从中提取了FANCB基因在各个样本中的表达数据,发现FANCB基因在肺腺癌和肺鳞癌中都处于高表达,在肺腺癌中增加了死亡风险(OR=1.17,95%CI:1.03-1.32,P<0.01),通过生存分析发现FANCB高表达的肺腺癌患者预后较差(OR=1.66,95%CI:1.26-2.19,P=0.00025)。同时体外cck8、Edu、集落形成、Transwell实验结果表明敲低FANCB基因后肺腺癌细胞株(PC9、H1975)的增殖能力和侵袭能力明显降低。结论:在中国人群中,FANCB基因rs754552650 A/G基因型携带者患肺腺癌的风险明显降低,FANCB基因促进了肺腺癌的发生及发展。
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