胃癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一。在所有肿瘤死亡中,约有8%归因于胃癌。对于进展期胃癌行化疗的过程中不乏出现肿瘤耐药的情况,这种现象大多与胃癌的高度异质性有关,即胃癌是多种不同分子实体的集合,而不是单一的均质疾病。因此,我们迫切需要对胃癌异质性进行研究以解决胃癌诊治中其异质性带来的问题。本研究将采用全外显子测序分析(whole exome sequencing,WES)探索胃癌的肿瘤异质性,并为胃癌的诊断与治疗,为寻找更多胃癌分子靶点提供依据。目的:通过WES研究胃癌原发灶不同点位及转移灶基因突变情况,进而探索胃癌的肿瘤异质性。方法:按照纳入和排除标准选取2例胃癌标本,分别于胃癌组织中心,3,6,9,12点及转移灶取组织于液氮罐中速冻后留存于-80℃冰箱。利用Agilent SureSureSelectHumanAll Exon V5试剂盒从基因组DNA中捕获外显子,然后再应用HiSeq PE150模式(双端测序)进行配对行全外显子测序分析,应用SpeedSeq进行比对和突变搜索,并行单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNP)分析和基因拷贝数的分析,对比国际癌症相关突变数据库Catalogue Of Somatic Mutations In Cancer(COSMIC),应用结果统计分析SNP后果:同义突变;非同义突变;停止密码子突变;再应用数据绘制两组数据12个点位的SNP突变热图,统计突变基因的数量;对比药物-基因互作数据库(DGIdb)筛选出可靶向的基因突变点位。最后利用筛选出的数据行异质性分析,指导临床实践中测序样本的选取。结果:1、SNP中,C:G→T:A碱基的改变最常见;SNP突变最常见后果为同义突变及非同义突变,同义突变略多于非同义突变;两组样本的非主干突变分别占12.6%,17.9%;两组样本的私有突变重叠率为0%,主干突变的重叠率分别为50.2%、59.0%,分支突变的重叠率分别为33.3%、22.6%。2、两组样本的SNP在COSMIC和DGIdb数据库筛选后共享了15个主干突变基因:NOTCH2、TP53、ALK、MSH6、SETD2、GATA2、APC、HLA-DRB5、HLA-DRB1、EGFR、PRSS1、MTAP、PTCH1、ORM1、CACNA1B;3、胃癌原发灶随机取样数为2时,第一组样本得到可靶向的非主干突变比例最大值和最小值为100%和75%;第二组样本为100%和43%;胃癌原发灶和转移灶随机取样数为2时,第一组样本得到可靶向的非主干突变比例最大值和最小值为100%和75%;第二组样本为100%和43%;结论:1、胃癌具有高度的肿瘤内异质性和患者间异质性;2、NOTCH2、TP53、ALK、MSH6、SETD2、GATA2、APC、HLA-DRB5、HLA-DRB1、EGFR、PRSS1、MTAP、PTCH1、ORM1、CACNA1B,这15个突变基因可以作为胃窦-幽门部肿瘤现存靶向药物的潜在治疗靶点;3、为了获得胃癌患者的基因突变情况进行分子靶向治疗,实体肿瘤2点取样或3点取样为一种经济有效的取样方式。