基于计算机辅助药物设计的维甲酸类、黄酮类和茋类化合物的筛选和细胞活性评价

被引量 : 0次 | 上传用户:lydr
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
计算机辅助药物设计是多学科相互交叉渗透的领域,它以计算机为基础,模拟和计算配体小分子与受体大分子之间的关系。计算机辅助药物设计的手段十分丰富,包括药效团模型、分子对接、同源模建和计算机辅助靶标识别等。维甲酸alpha受体(RARα)是治疗急性早幼粒白血病的关键靶标之一,本文首先从受体占领学说出发利用Discovery Studio2.5中的三维定量构效关系模块对RARα激动剂分子建立结合亲和力模型(KI模型)和药效模型(ECso模型)。通过参数验证、Fischer随机验证和最大无偏验证得到Ⅺ模型和ECso模型的最优药效团模型分别是Hypo1K和Hypo7E。利用Hypo1K和Hypo7E对美国癌症中心(NCI)数据库进行虚拟筛选,对具有CAS编号的化合物进行文献搜索,发现筛选结果中有6个化合物已经被证实对白血病细胞或者其他肿瘤细胞有抑制作用。通过验证和筛选结果的活性数据,可以推断出Hypo1K和Hypo7E是可信赖的寻找新型RARa激动剂的工具。其次本文测试本课题组合成的黄酮衍生物对人肝癌细胞HepG2和人正常肝细胞L-02的体外增殖抑制作用,结果显示化合物9(IC50=9.0μmol/L)、29(IC50=5.5μmol/L)和37(IC50=6.6μmol/L)对HepG2细胞有很强的抑制作用。对于L-02细胞的体外增殖抑制作用实验中,只有化合物23(IC50=8.2μmol/L)显示出较强的抑制作用。将有活性的化合物分子提交到PharmMapper平台上进行潜在靶标筛选得到可能作用的靶标——胸苷酸合成酶,并用分子对接进行验证。最后本文测试本课题组合成的芪类化合物对HepG2和L-02细胞的体外增殖抑制作用,结果显示当苯乙烯基团的苯环有二甲氧基双取代时,苯并咪唑环上的N原子无甲基取代的化合物(S001:IC50=26.3pmol/L, S005:IC50=48.2μmol/L和S007:IC50=52.2μmol/L)要比有甲基取代的化合物(S002:IC50=77.6μmol/L, S006:IC50=80.6μmol/L和S008:IC50=65.2pmol/L)对细胞的抑制作用强。将芪类化合物与其作用蛋白——可溶性环氧化物水解酶进行分子对接,结果显示该类化合物与蛋白的相互作用力与细胞活性实验一致。
其他文献
"光"与"影"及其相互关系在建筑画中的表现与效果是本文所关心的问题。光影作为建筑画中水彩表现技法中的一种重要的艺术语言,具有独特的艺术表现力。光影在当今的建筑水彩画
光伏并网发电系统的设计及控制参数整定都是基于理想并网条件,并未考虑电网阻抗的影响。而对于光伏发电系统通过较长的输电线路、多级升压接入地区电网或以分布式发电系统直接
测井曲线的质量易受井眼环境因素的影响,井径扩径段井壁凹凸不平、泥浆侵入、泥饼等容易造成曲线畸变失真,特别是探测深度较浅的密度和声波时差曲线。笔者利用曲线之间的内在
自从进入二十一世纪以来,中国汽车市场一直保持着较高、较快的的增长速度。2013年中国汽车的产销量均超过2000万台,中国正式超过美国,成为全球第一大汽车产销市场。全球各大
近年来,由于内蒙古地区经济的发展,社会的进步促使牧区房屋的建设较为迅速。由此,随着生活方式的变迁,内蒙古牧区的典型传统居住形式—蒙古包,已逐渐被人们遗忘。取而代之的
当前,基层消防部队训练科目较多,强度较大,在训练过程中,时常有人员受伤的情况发生。本文就基层消防部队在开展训练过程中如何有效避免训练损伤提出了一些自己的见解。
岩爆是坚硬脆性岩体在高应力集中区发生的,源于弹性能突然释放,伴有可感知声响,以动态弹射或崩溃抛掷破坏为典型表现形式的特殊地压显现。岩爆发生机理研究,特别是岩体岩爆倾
目的检测自噬相关基因Beclin1、LC3和多药耐药基因LRP、GST-π、TopoⅡ在大肠癌中的表达,探讨自噬对大肠癌多药耐药性(multidrug resistance,MDR)的影响。方法应用免疫组化En
蛋白质和多糖是构成食品体系的两类重要的高分子材料,也是决定食品微观结构、质构特性和感官特性的重要因素,故而蛋白质和多糖的相互作用研究一直是食品科学的研究重点。本研
酚醛环氧防腐涂料在石油化工领域应用越来越广泛,本论文依据石油钻杆内涂层的行业标准SY/T0544-2010《石油钻杆内涂层技术条件》的技术标准,研究制备了一种新型的酚醛环氧防