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配套系育种是养猪发达国家育种工作的方向,也是今后我国猪种改良、选育的发展趋势。我国对配套系的研究尚处于起步阶段,与国外发达国家相比尚有较大差距,尤其在分子方面。对多系配套的综合杂种优势的利用意识不够,对杂种优势产生的机理认识不足。本研究旨在于利用分子遗传标记和数量遗传学原理对我国引入的杜长大杂交繁育体系、斯格配套系进行科学的研究,对各个品种内部的群体结构,主要经济性状和标记位点的关系进行分析,探讨多品系配套的遗传效应。通过分析各个品系的遗传标记特性反推品系的培育过程和方法,为建立符合我国国情的瘦肉猪繁育体系提供理论依据。研究结果如下: 1.对杜长大三元杂交繁育体系的五个种群,斯格猪配套系的八个种群的遗传结构进行了分析,探讨了群体之间的遗传关系和群体内的遗传变异。结果表明:同一位点在纯种群中出现的等位基因数不完全相同,基因频率差异也较大,认为纯种群具有不同的遗传基础。 2.纯种群体的平均位点杂合度和平均多态信息含量都比较高,认为纯种群体内部在8个标记位点上具有较为丰富的遗传多样性。纯种、祖代、父母代、商品代群体的平均位点杂合度和多态信息含量随着群体在杂交繁育体系中位置的由高到低而逐渐升高,平均位点杂合度与杂种优势呈正相关,可以用来预测杂种优势。 3.根据计算出的Nei氏标准遗传距离显示,父本和母本间的遗传距离大,遗传距离大的父本和母本首先用于杂交,遗传距离大可以产生较大的杂种优势,因而遗传距离可用于预测杂种优势。 4.不同的种群在不同的微卫星位点上有特异的条带,可以作为专门化品系定位的辅助标记,S0214位点136bp、138bp可作为父本父系的选育方向的特有条带,S0003位点161bp、162bp可作为母系方向选育的特有条带,S0003位点的154bp、155bp可作为母本母系方向选育的特有条带,S0515位点中156bp和154bp、160bp和161bp是母本父系不具有的条带。 5.固定系数Fst在斯格猪和杜长大纯种上的遗传分化处于较小到中等之间,可作为专门化品系选育程度的指标。 6.本试验对配套系在背膘厚、全程日增重,前期日增重和母猪的产仔数、产活仔数、断奶仔数、产仔窝重、断奶窝重、出生重、断奶重的基因效应进行了分析,发现不同性状的遗传学效应是不同的,本试验结果显示初生重、断奶重、早期日增重、全程日增重、背膘厚的遗传学效应主要由加性效应产生的,产仔数、产活仔数、断奶仔数的遗传学效应主要由上位效应产生的,产仔窝重、断奶窝重的遗传学效应主要由显性效应产生的。 7.本研究提出了多系配套杂交群体选育的方法,育种工作在杂交繁育体系内进行,一方面采用常规育种技术和分子标记辅助选择或标记辅助渗入相结合的技术体系,运用多性状的动物模型技术进行种猪的遗传评估,选育各具特色的专门化品系,另一方面开展杂交测定及收集杂交信息的反馈,确定杂交组合。