用RNA-seq技术鉴定Bt蛋白对拟环纹豹蛛安全性的影响

来源 :湖南农业大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:smailfish2006
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
近年来,转Bt基因粮食作物对害虫的控虫作用受到广泛的应用,它可以减少广谱杀虫剂对环境造成的污染。水稻作为亚洲国家主要的粮食作物,正面对严重的虫害问题和杀虫剂污染问题。因此,转Bt基因水稻逐渐被用来缓解这种局势。转Bt基因水稻给环境与农业生产带来巨大利益的同时,其潜在的危险同样受到关注。Bt蛋白在稻田生态系统复杂的食物网中的传递,以及对非靶标生物的影响是人们担忧的主要问题之一。本研究就试图利用转录组高通量测序技术鉴定Bt水稻对稻田蜘蛛优势种拟环纹豹蛛(Pardosa pseudoannulata)安全性的影响。内容具体如下:1.用RNA-seq技术鉴定Bt蛋白对拟环纹豹蛛捕食功能及搜寻行为的影响为了探究Bt蛋白对拟环纹豹蛛捕食功能的影响及其机理。用富集Bt蛋白的褐飞虱饲养拟环纹豹蛛,比较富集过Bt蛋白的拟环纹豹蛛与正常蜘蛛捕食功能以及搜寻行为差异,并解剖拟环纹豹蛛的神经节做转录组分析,观察Bt蛋白作用下神经节基因的表达情况。同时,随机选择了4个DEGs基因进行了qPCR验证。结果表明,Bt蛋白对拟环纹豹蛛的捕食功能没有影响,但会显著增强拟环纹豹蛛的搜寻行为。结合转录组分析,神经细胞内氧化磷酸化反应显著增强可能是拟环纹豹蛛变得兴奋的关键因素,而其体内一些次级代谢产物代谢途径的富集可能与蜘蛛体内对Bt蛋白的防御机制相关,其转录组结果与qPCR验证结果一致。2.用RNA-seq技术鉴定Bt蛋白对拟环纹豹蛛毒腺基因表达的影响Bt蛋白是一种杀虫晶体蛋白,能与昆虫肠道上皮细胞上的特异性蛋白结合,导致膜上孔洞的形成,造成昆虫的死亡。本研究利用转录组高通量测序技术,对富集了Bt蛋白的拟环纹豹蛛毒腺与正常拟环纹豹蛛毒腺进行了深度测序,得到113358条unigene。通过比对COG, GO, KEGG等数据库,对拟环纹豹蛛毒腺基因进行功能注释,并且探究了在两样本中差异表达的基因。其中上调基因3765条,下调基因3157条,主要参与的代谢途径为氧化磷酸化途径、核糖体等相关途径。本研究初步证明Bt蛋白对拟环纹豹蛛毒腺基因表达有一定影响。同时也为全方面了解蜘蛛毒腺基因组以及基因进化提供了帮助。3.用RNA-seq技术鉴定Bt蛋白对拟环纹豹蛛生长发育的影响为了探究Bt蛋白对拟环纹豹蛛生长发育的影响及其机制,通过ELISA检测来探究Bt蛋白在拟环纹豹蛛成蛛和3龄,5龄幼蛛体内各组织中的富集规律;分别记录实验组和对照组幼蛛的发育历期,体长、背甲宽、体重变化,取食量,存活率等参数;比较两组成蛛和幼蛛体内三大组织(肌肉组织,消化组织,神经节)及其亚细胞结构中5种解毒酶(POD, CAT, SOD, GSH-Px, AChE)酶活的活性。取5龄幼蛛做转录组测序分析,通过差异表达分析和功能注释了解Bt蛋白作用下实验组蜘蛛差异表达基因的生物学功能,探究Bt蛋白影响幼蛛生长发育的分子机制。同时,随机选择了4个DEGs基因进行了qPCR验证。结果表明,Bt蛋白可以在拟环纹豹蛛的各组织结构和亚细胞结构中富集,并会影响到拟环纹豹蛛的生长发育和两种关键的的酶,AChE和POD。转录组分析结果表明,幼蛛体内一些直接调控生长发育的生物学功能的改变,如生长激素受体信号途径,幼体发育,幼体龄期的发育,中肠的发育,体肌的发育等是造成发育显著延迟,体重降低的主要原因;还有一些供能物质代谢途径的改变,如糖酵解糖异生,三羧酸循环,氧化磷酸化,淀粉蔗糖的代谢,脂肪酸代谢等可能间接影响到幼蛛体内解毒酶的活性,进而直接或间接的影响到幼蛛的生长发育。其转录组结果与qPCR验证结果一致。4.用RNA-seq技术鉴定Bt蛋白对拟环纹豹蛛繁殖的影响实验室条件下研究了Bt蛋白对拟环纹豹蛛繁殖能力的影响及其分子机制。以分别取食Bt水稻或正常水稻15天的褐飞虱喂食拟环纹豹蛛,比较两组蜘蛛的繁殖能力(产卵前期、产卵量、卵袋数、孵化率)是否有差异,在宏观层面上探究Bt蛋白对拟环纹豹蛛繁殖能力的影响;取蜘蛛性腺做转录组分析,研究性腺中繁殖相关基因的表达是否受到影响,从分子层面上解释Bt蛋白对拟环纹豹蛛的作用机制。同时,我们对8个卵黄蛋白基因进行了qPCR验证。结果表明,Bt蛋白可以沿着食物链传递,从水稻通过褐飞虱在拟环纹豹蛛体内富集,其最大富集量为0.396ng/g,而拟环纹豹蛛的繁殖能力不受Bt蛋白的影响。基因差异表达分析显示,性腺中直接调控繁殖的有806个unigene,这些unigene参与到23种不同的生物学功能和4条代谢途径,且都没有差异表达;而以FDR<0.01, log2fold change>2筛选得到的49个显著差异表达基因参与到的生物学功能和代谢途径都不与蜘蛛的繁殖直接相关。在Cry1Ab蛋白胁迫下,8个与卵黄蛋白合成相关的基因均未发生表达差异,其转录组结果与qPCR验证结果一致。因此,Bt蛋白不影响拟环纹豹蛛的繁殖能力,其主要原因是性腺中繁殖相关基因的表达并没有受到影响。
其他文献
回 回 产卜爹仇贱回——回 日E回。”。回祖 一回“。回干 肉果幻中 N_。NH lP7-ewwe--一”$ MN。W;- __._——————》 砧叫]们羽 制作:陈恬’#陈川个美食 Back to yield
一、会议地点本次会议将在上海光大会展中心举行。上海光大会展中心位于上海市徐汇区,周围有便利的交通可至机场、火车站、市中心和购物中心。
为研究猪气喘病的临床鉴别方法以及防治方法。该研究选出200例经兽医院确诊为猪气喘病的猪作为研究对象,饲养者自愿接受本兽医院的治疗并同意参与此次研究,时间段为2018年6-1
目的探讨五苓散治疗特发性正常颅压脑积水的综合疗效。方法从我院于2012年3月—2016年5月收治的众多特发性正常颅压脑积水患者中随机抽取70例作为本次研究对象,并将其按不同
目的:为研究MTMR 14基因在肺癌细胞中的功能.方法:运用CRISPR/Cas9基因编辑技术得到基因敲减的人胚肾细胞株(293T),筛选了1对具有编辑作用的sgRNA作用于腺癌人类肺泡基底上皮
目的:观察辛伐他汀二甲双胍联合治疗非乙醇性脂肪性肝病的疗效。方法:63例非乙醇性脂肪性肝病随机分为两组,甲组在常规饮食治疗和保肝治疗的基础上给予辛伐他汀10 mg,1次/d,二甲双
目的:探讨脑出血急性期的急救护理效果。方法:选取河南省西华县人民医院内科收治的脑出血急性期患者74例作为研究对象,按照护理方式划分,对照组34例采用常规护理,观察组40例
木霉(Trichoderma)是真菌中重要的生物防治菌之一。本文以从土壤中分离获得的具有抑菌作用的钩状木霉(Trichoderma hamatum)为研究对象,采用比较基因组学和蛋白组学等方法,分
沙打旺(Astragalus adsurgens)是我国特有豆科牧草,适宜于干旱、半干旱和半荒漠地区,具有治理水土流失等生态作用。沙打旺黄矮根腐病是由沙打旺埃里砖格孢(Embellisia astrag
盾壳霉(Coniothyrium minitans)是核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)重寄生真菌,对作物菌核病有显著控制作用。分生孢子是盾壳霉生长发育的重要环节及其生防制剂的主体,研究