毛尾线虫（Trichuris spp.）又称鞭虫，属于无尾感器纲(Aphasmidea)、毛尾虫目(Trichurata)、毛尾虫科(Trichuridae)、毛尾虫属（Trichuris），可寄生于多种宿主，为人体和动物肠道常见的寄生线虫。线粒体DNA(mtDNA)是后生动物细胞核外的遗传物质，它具有分子量小、结构简单、进化速度快、母性遗传等特点，是研究寄生虫分子分类、群体遗传、系统进化的一种很好的分子标记。线虫是动物界比较大的动物群体，迄今为止，只有大约40种（株）线虫mtDNA被完整测序。因此，对线虫mtDNA的了解还相当浅显。本项研究以人和猪的毛尾线虫为研究对象，以其线粒体基因组为研究内容，对寄生于人和猪的毛尾线虫线粒体部分基因的多态性、以及全基因组序列进行了测序及分析。　　 本研究的第一部分应用PCR和DNA序列分析方法，对猪毛尾线虫mt基因组中的两个基因片段，即烟酰胺脱氢酶亚基I（nad1）基因和细胞色素b（cytb）基因进行多态性分析，以期找到研究猪毛尾线虫分子分类学、种群遗传关系的良好遗传标记。序列分析结果表明，nad1序列种内差异为0-3.67％:cytb序列种内差异为0-4.7％；而种系发育关系分析表明，不同省的毛尾线虫聚在一起，同一地区的分离株却位于在不同分支上，不能很好地区分不同省或者不同地区的地理株，种内地区分化不明显。出现这种现象可能与基因选取的不合适、选取片段过短有关，或者由于我国的猪毛尾线虫分离株线粒体基因本身变异不大，也可能是我国各地生猪调动导致基因流动的发生，因此，我国猪毛尾线虫的遗传变异和种群结构还需要迸一步的研究和探讨。　　 本研究第二部分，选择人和猪的毛尾线虫作为mtDNA完整测序的对象，采用长PCR扩增方法，对猪毛尾线虫用引物对分别扩增出4个长约4.0kb左右的mtDNA片段，而人毛尾线虫则利用3对长PCR引物扩增得到3段长约4.5kb左右的mtDNA片段。测序结果显示，人毛尾线虫线粒体基因组全长为14，046 bp(GenBankTM注册号GU385218)，A+T含量为68.05％:猪毛尾线虫线粒体基因组全长为14，436p(GenBankTM注册号GU070737)，A+T含量为71.43％。两种毛尾线虫mtDNA全基因组均由13个蛋白质基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因组成。人和猪毛尾线虫都有两个全长为270bp和261bp的非编码区(AT区)。各基因排序方式与其它线虫完全一致，基因无内含子，各基因之间没有基因间隔或有一到几十个碱基的基因间隔。在13个蛋白质的基因中，以ATG、ATA作为蛋白质翻译的起始密码子；多数蛋白质翻译的终止密码子为TAA，其次是TAG。　　 以猪带绦虫为外群，以mtDNA作为遗传标记，重构了部分线虫的系统发育关系。结果显示：人和猪毛尾线虫分为两个进化支，并且与旋毛虫的关系较近，说明人和猪的毛尾线虫是两个不同的种。　　 本研究在国内外首次完成了人和猪的毛尾线虫mtDNA全序列测定，不仅丰富了线虫线粒体基因组的研究内容，而且在研究寄生虫分子分类学、种群遗传结构以及寄生虫防控等方面都有重要的意义。