VDR及DBP基因多态性与HBV背景下肝炎、肝硬化、肝癌遗传易感性研究

来源 :广西医科大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:XULIANSHUAI
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目的:研究维生素D受体(vitamin D receptor,VDR)基因的单核甘酸多态性(SNP)位点rs11568820、rs2228570、rs3782905和维生素D结合蛋白(vitamin D binding protein,DBP)基因SNP位点rs7041在广西人群中的分布;分析rs11568820、rs2228570、rs3782905和rs7041四个SNP位点与广西HBV背景下慢性肝炎、肝硬化、肝癌患病风险之间的关系。为HBV感染相关肝病的防治提供新思路。方法:采用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)技术、聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)技术及DNA测序法,对广西HBV背景下的192例慢性乙型肝炎(CHB)患者、104例肝硬化(LC)患者、184例原发性肝细胞癌(HCC)以及180例健康体检者的VDR基因rs11568820、rs2228570、rs3782905和DBP基因rs7041四个SNP位点进行检测,并使用Roche e601电化学发光免疫分析仪测定其血清25-羟基维生素D水平。运用SHEsis在线软件对VDR基因rs11568820、rs2228570、rs3782905位点构建单倍型,并分析其与CHB、LC及HCC患病风险之间的关系。使用拟合优度2检验分析各组各位点基因型分布是否符合哈-温平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)。使用Logistic回归分析,对性别、年龄因素进行校正,计算比值比(Odds ration,OR)以及95%可信区间(Confidence Interval,CI),分析各位点与CHB、LC及HCC患病风险间的关系。结果:1.各组4个位点基因型的频率分布均符合HWE(p>0.05),本研究人群具有代表性和可比性;2.广西人群VDR基因rs11568820位点发现GG、GA、AA三种基因型,GA基因型和A等位基因可降低CHB的患病风险(p=0.045,OR=0.637,95%CI:0.410-0.991;p=0.037,OR=0.725,95%CI:0.536-0.980)。VDR基因rs2228570位点存在CC、CT和TT三种基因型,TT基因可增加CHB和HCC的患病风险(p=0.047,OR=1.792,95%CI:1.008-3.187;p=0.019,OR=2.149,95%CI:1.134-4.075),T等位基因亦可增加CHB和HCC的患病风险(p=0.046,OR=1.342,95%CI:1.005-1.792;p=0.016,OR=1.489,95%CI:1.077-2.060)。VDR基因rs3782905共发现CC、CG、GG三种基因型,各基因型和等位基因与CHB、LC、HCC的患病风险均无明显相关(p>0.05)。DBP基因rs7041位点出现TT、TG、GG三种基因型,GG基因型可显著增加LC和HCC的患病风险(p=0.002,OR=4.011,95%CI:1.676-9.603;p=0.026,OR=2.576,95%CI:1.121-5.921),G等位基因可明显增加LC和HCC的患病风险(p=0.007,OR=1.727,95%CI:1.159-2.572;p=0.024,OR=1.501,95%CI:1.055-2.136)。3.男性人群中,VDR基因rs11568820位点各基因型和等位基因与CHB、LC、HCC的患病风险均无明显相关(p>0.05)。VDR基因rs2228570位点CT基因型、TT基因型和T等位基因均可增加CHB和HCC的患病风险。VDR基因rs3782905位点各基因型和等位基因与CHB、LC、HCC的患病风险均无明显相关。DBP基因rs7041位点GG基因型和G等位基因可显著增加LC、HCC的患病风险。4.女性人群VDR基因和DBP基因的四个SNP位点均与CHB、LC、HCC的患病风险均无明显相关(p>0.05)。5.VDR基因rs11568820、rs2228570和rs3782905位点共构建出7种单倍型,GTC单倍型可明显增加CHB的患病风险(p=0.014,OR=1.492,95%CI:1.085-2.054),ACC和GCG单倍型均明显降低HCC的患病风险(p=0.014,OR=0.572,95%CI:0.365-0.896;p=0.011,OR=0.464,95%CI:0.254-0.847)6.广西人群VDR基因和DBP基因4个SNP位点各基因型及等位基因频率与亚洲地区黄色人种相近,而与黑色人种和白色人种有较大差异。7. CHB组、LC组和HCC组三者间两两比较,血清25-羟基维生素D水平差异均具有统计学意义(p<0.05),按CHB组、LC组和HCC组递增。结论:1.VDR基因rs11568820位点的GA基因型和A等位基因可能是CHB患病的保护因素;VDR基因rs2228570位点的TT基因型和T等位基因可能是CHB和HCC患病的危险因素;DBP基因rs7041位点GG基因型和G等位基因可能是LC和HCC患病的危险因素。2. VDR基因rs2228570位点的CT基因型、TT基因型和T等位基因可能是男性人群CHB和HCC患病的危险因素;DBP基因rs7041位点GG基因型和G等位基因可能是男性人群LC和HCC的危险因素。3.维生素D可能参与HBV背景下肝病的发生发展,其水平随严重程度增加而递增。
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