苏太猪FUT1基因及其他候选基因的遗传效应分析

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本研究采用PCR-RFLP和PCR-SSCP方法研究了576头苏太猪试验群FUT1基因M307位点多态性,并分析了其与部分经济性状的相关性。同时还对苏太猪Mx1、DQB、DQA和GH基因共5个多态位点的多态性与部分生长性能进行了相关性分析,并分析了苏太猪ESR基因多态性与繁殖性状的相关性。旨在通过标记辅助选择加快苏太猪专门化品系配套的培育进展,为苏太猪的进一步培育提供一定的理论依据。具体结果如下:(1) FUT1基因M307位点PCR产物长度为161bp,采用限制性内切酶Hin6Ⅰ消化后共出现3种基因型,分别为AA、AG和GG基因型,基因型频率分别为0.235、0.609和0.156。抗病基因A的基因频率为0.540,敏感基因G的基因频率为0.460。经卡方适合性检验,发现该群体偏离了Hardy-Weinberg平衡状态。(2)利用最小二乘拟合线性模型,对FUT1基因M307位点不同基因型与苏太猪部分早期生长性状、体尺性状和胴体性状进行显著性检验,结果显示:AA型个体和AG型个体30日龄断奶重均显著高于GG基因型个体(P<0.05);AA型个体的体长、体高和后躯宽均显著高于AG型的个体(P<0.05),且AA型个体的体长也显著高于GG型个体(P<0.05);AA基因型个体的背膘厚比AG和GG型个体较低。(3)利用PCR-RFLP方法对苏太猪培育群体中Mx1、DQB-RsaⅠ、DQB-HaeⅢ位点进行了多态性检测,Mx1基因位点和DQB-RsaⅠ基因位点多态性非常丰富,均检测到3种等位基因,5种基因型,但前者没有发现CC基因型,后者没有发现BC基因型,等位基因A对群体中Mx1基因位点和DQB-RsaⅠ基因位点而言均绝对优势;对于DQB exon 2-HaeⅢ检测到2种基因和3种基因型,等位基因D占绝对优势;利用PCR-SSCP方法对DQA基因进行多态性检测,产生了CC、CD和DD三种基因型,等位基因C占绝对优势。对突变位点进行测序,发现第4外显子的5233处发生碱基G→A的突变,突变的结果导致相应的氨基酸由丙氨酸代替了苏氨酸。其中DD型为野生型,而CC型为突变型。经卡方适合性检验,除DQB exon 2-RsaⅠ位点处于Hardy-Weinberg非平衡状态外(P<0.01)。其他位点均处Hardy-Weinberg平衡状态。(4)分别对4个基因位点各自不同基因型对早期生长性能的效应作最小二乘分析。结果显示:Mx1基因不同基因型对苏太猪初生重、35日龄断奶重影响无显著性差异,BC基因型对苏太猪初生重和35日龄断奶重的影响均略高于其它基因型个体;对于DQB基因的RsaⅠ酶切位点,基因型为AC的个体初生重极显著高于AA型个体(P<0.01);对于DQB基因的HaeⅢ酶切位点,基因型为DE的个体初生重极显著高于DD型个体(P<0.01);对于DQA基因,基因型为CD的个体初生重极显著高于CC型个体(P<0.01)。(5)对GH基因进行基因多态性检测,统计结果发现,等位基因D的频率高达0.821,D等位基因占绝对优势。利用最小二乘拟合线性模型,对苏太猪pGH基因ApaⅠ突变位点不同基因型与生长性能进行显著性检验,结果显示:不同基因型对苏太猪初生重、30日龄体重、4月龄体重和6月龄体重影响无显著性差异(P>0.05)。CC基因型的生长性状在不同阶段表现都是最高的。(6)对ESR基因进行基因多态性检测,统计结果发现,B等位基因为群体中的优势等位基因。利用最小二乘拟合线性模型,对苏太猪ESR基因PvuⅡ突变位点不同基因型与繁殖性能进行显著性检验,结果显示:在初产母猪中AA基因型个体的产活仔数(NBA)、初生窝重(BLW)和经产母猪中的断奶成活数(NW)均显著高于BB基因型和AB基因型个体(P<0.05);经产母猪中AA基因型个体的总产仔数(TNB)极显著高于AB和BB基因型个体(P<0.01),同时,AA基因型个体的断奶窝重(WWL)也显著高于BB基因型个体(P<0.05)。(7)对FUT1抗病基因群与敏感基因群的各候选基因多态性进行分析,结果发现多态性均与原始试验群多态性差异不大。除DQB exon 2-RsaⅠ位点在FUT1AA基因群中处于Hardy-Weinberg非平衡状态外,其他位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。(8)分析FUT1基因抗病型和敏感型群体的各候选基因分布差异,发现抗性群体中的ESR基因的优秀基因型AA频率和GH基因较优秀基因型CC的频率均略高于敏感型群体。(9)以本研究的实验方法和结果为指导,结合其他相关资料,对苏太猪高产高效抗病品系的培育过程作了说明和分析。
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