桃（Prunus persica（L.）Batsch）是中国重要的经济果树之一。一些桃品种在果实成熟时出现缝合线部位提前软化的现象,严重影响果实品质,降低经济效益。北京2号晚熟芽变突变体比北京2号晚成熟15天,且缝合线部位出现提前变软和现红的特征,是研究缝合线软化的优异材料。本研究包括3个部分,主要研究结果如下:调查秦皇岛地区的31个桃品种（系）,根据缝合线部位软化早晚,对其进行分级。从中筛选出3个易软品种（Z1-2、超越2号和燕红）和3个缝合线不易变软的对照品种（曙光、P2-1和晚久保）。生理指标的测定结果显示,易软品种缝合线处硬度显著低于果面,而乙烯峰度和花青素含量显著高于果面部位;在对照品种中,乙烯峰度、花青素含量与硬度在缝合线和果面部位的差异均不显著。在6个品种中,缝合线处的可溶性固形物含量在均低于果面,ABA变化没有规律可循,与缝合线软化无相关性。北京2号晚熟芽变突变体缝合线处花青素含量高于果面部位,在成熟后期缝合线和果面处硬度差异显著,乙烯高峰推迟,导致突变体果实软化延迟。基于Illumina HiSeq^TM2500高通量测序平台对北京2号和其突变体成熟后期的果实上的缝合线和果面处果肉进行转录组测序,发现在突变体的缝合线和果面部位有1889个差异表达基因。KEGG代谢通路富集分析发现,差异表达基因显著富集的代谢途径有植物激素信号转导、次生代谢物的生物合成、植物病原菌互作、苯丙烷类生物合成和代谢途径等代谢途径。根据桃果实缝合线和果面部位相关的差异基因表达分析和KEGG代谢途径分析,从转录组中共筛选到46个与果实缝合线软化和现红有关的基因,其中包括9个细胞壁降解相关基因（PG1、PL5、BGAL1、PME48、XTH33、STP13、SUS7、SS和EXPA4）,13个植物激素信号转导途径基因（ETR2、ACS1、ACO1、IAA7、IAA8、IAA29、AUX22、AUX28、GH3.1、ARF1、SAUR36、AHK4和ARR3）,10个果实颜色代谢途径相关基因（PORA、HO1、CYP707A1、NCED1、LUT2、DFR、CHS2、CHI3、F3H和ANS）,14个转录因子（3个MYB,1个NAC、2个ERF、3个BHLH和5个WRKY）。克隆了一个果实软化相关的PME基因,命名为PpPME48（登录号:MT019687）。生物信息学分析表明,PpPME48蛋白编码370个氨基酸,蛋白质分子量为41187.06 Ku,包含1个果胶甲酯酶结构域,具有1个较长的N端-PRO区域,属于TypeⅡ型。进化树分析表明,PpPME48蛋白与扁桃、乌梅和甜樱桃的PME蛋白亲缘关系较近。荧光定量PCR结果显示,PpPME48基因在缝合线易软品种燕红中的表达高于不易软化品种晚久保,而且在缝合线处的表达量明显高于果面处。因此,推测PpPME48基因可能与缝合线变软密切相关。