农业是我国的基础产业,在我国农业发展面临资源和环境双重约束的背景下,农业生产的发展不能完全依靠生产资料的无限投入,还需要提高农业生态效率。科学技术是第一生产力,科学技术的进步必然会促进农业生态效率的提高,那么科技资源应该如何配置和引导?科技投入和农业生态效率存在怎样的关系?鉴于此,本文建立理论分析框架,从理论和实证两个层面来探讨我国科技投入对农业生态效率的影响,并提出相关建议。本文研究分析科技投入对农业生态效率的影响。在研读过往学者的成果之后,利用数据包络分析发对我国农业生态效率进行测度,分析为我国全国水平和各省份历年来的农业生态效率、农业纯技术效率和农业规模效率,在考察期内,我国农业生态效率仅处于中等水平,平均水平按照东部、中部、西部和东北地区依次递减。利用Dagum基尼系数法和Kernel密度分析法探究我国农业生态效率的空间异质性及其动态演进,地区间绝对差异呈现“先扩大后缩小”的态势,农业生态效率的地区非均衡发展状况得到改善。使用门槛效应模型,将农业科技人员、农业科技内部经费支出和农业科技应用发展支出分别作为门槛变量,来分析我国30个省份科技投入对农业生态效率的门槛效应,得出三个门槛变量对农业生态效率有显著影响,在分别达到各自合适的门槛区间时,对农业生态效率的提升效果更好。以农用化肥折纯使用量、农药使用量和农膜使用量为中介变量,建立中介效应模型,对科技投入、农业面源污染和农业生态效率三者之间的关系进行实证检验,探究科技投入对农业生态效率影响的机制分析,得出农业科技人员通过增加农用化肥折纯使用量来促进农业生态效率、农用科技内部经费支出通过减少农用化肥折纯使用量来促进农业生态效率,农用科技实验发展支出通过减少农用化肥折纯使用量来抑制农业生态效率。最后根据实证研究的结果,从农业技术推广、生态意识等多个角度对科技支农提出相应的建议。