SOX2作为一种重要的转录因子，已经在脊椎动物中被确定参与胚胎发生、神经发生、晶状体发育以及诱导多能性胚胎干细胞形成中发挥重要的功能。本研究以重要的双壳类海洋经济物种——栉孔扇贝(Chlamys farreri)作为研究对象，通过RACE技术克隆获得了sox2的cDNA全长序列，并采用半定量RT-PCR、实时荧光定量PCR和原位杂交技术对其在栉孔扇贝早期发育的表达特征、各组织中的空间表达以及成体各发育时期性腺的表达定位进行了分析，以期为深入探讨该基因在扇贝中的作用提供基础数据。主要结果如下：栉孔扇贝sox2(Cf-sox2)的cDNA全长序列为2194bp，包含一个编码327个氨基酸的开放阅读框，并具有SOX家族保守的HMG-box以及SOXB1亚族的SOXp motif结构。进一步发现栉孔扇贝SOX2中不存在脊椎动物SOX2中的两个末端结构，即在N末端不含有多聚甘氨酸结构，在C末端不具有富含丝氨酸的结构。实时荧光定量RT-PCR结果显示，Cf-sox2是母源性基因；其表达量在卵裂期胚胎中较受精卵显著升高，囊胚中达到最高；原肠胚之后，表达量显著下降，并在壳顶幼虫降到最低。整体原位杂交结果显示，阳性信号在原肠胚之前呈弥散分布；进入幼虫时期后，阳性信号开始集中，担轮幼虫中主要集中在虫体中部，靠近顶鞭毛的基部以及靠近壳腺原基细胞周围；D形幼虫则集中在内脏团处；壳顶幼虫信号的强度减弱，并且仅在疑似脏神经节和足神经节处有可见的阳性信号。这个表达图式与哺乳动物类似，推测该基因可能参与栉孔扇贝胚胎和幼虫组织器官的形成。Cf-sox2mRNA在增殖期和生长期成体组织中的半定量RT-PCR检测结果显示，其在精巢、卵巢和闭壳肌中均有表达，其次在生长期的外套膜和鳃中也检测到一定水平的表达；肾和肝胰腺中没有可见的表达。对栉孔扇贝成体精巢和卵巢各发育时期的Cf-sox2定位检测发现，其在各时期的所有类型的生殖细胞和滤泡细胞中均有表达，但信号强度在细胞之间存在差异，推测该基因可能参与成体组织的功能维持和配子的发生过程。