绩效评价是高校管理中的重要环节，绩效评价对于克服高校管理中存在的问题，实现管理机制创新，改进高校绩效有现实的意义。在我国，高校绩效评价的理论和实践都亟待完善，以适应经济、社会发展的要求。 本文通过分析我国高校绩效评价的现状，发现高校绩效评价中存在很多问题：第一，没有把长远发展战略与短期目标联系起来，往往是多个方案同时进行，互相争夺资源；第二，传统的绩效评价集中在教学和科研上，没有评价资金等资源的使用是否高效，也没有重视提高经济效益，指标体系重产出轻投入；第三，绩效评价游离于日常工作之外，没有把评价与工作过程紧密结合在一起，也就不能发挥评价在工作过程中的控制作用。第四，评价目的是奖惩性的，大多用来发放薪酬和津贴，没有进行信息反馈，达不到改进教育工作、提高教育质量的目的。针对这些问题，本研究采用平衡计分卡绩效评价系统来设计我国高校绩效评价体系，该系统以战略目标为导向，包括了顾客、内部流程、学习与成长、资源四个方面的内容。其中，顾客维度包括了学生评价教师、培养人才、科研成果、改革与特色四个方面。内部流程维度可分解为教学、科研、行政管理三个方面的目标，学习与成长维度主要是指师资队伍建设，资源维度可以理解为办学条件，它为高校办学提供一个硬环境。通过这四个方面的指标，平衡计分卡平衡了长期目标与短期目标、外部群体与内部群体、结果与驱动因素、财务指标与非财务指标，实现了学校各方面工作协调发展。 因果关系分析是平衡计分卡的最大特色，本文给出了四个方面指标的因果关系图，当绩效结果不理想时，可以顺着因果关系链，层层查找原因，明确绩效改进的方向。接着，本文探讨了高校平衡计分卡的实施程序，包括成立平衡计分卡实施团队、阐明与诠释战略目标，连结个人目标和奖励，把战略计划与资源分配和经营预算联系起来，反馈并进行学习。分析了实施中可能存在的问题：目标确定和指标设置的主观性；避免把绩效评价搞成数字游戏或是填表活动；实施的成本较高。并针对问题给出对策措施：提高指标设计者和评估实施者的素质；纠正对平衡计分卡的错误认识；进一步完善信息系统；让全体教职工参与进来；加强成本费用控制；绩效评价与自我评价相结合。