企业税务风险的爆发,除了会使其被法律制裁以外,还可能损害到企业的声誉和财产,更甚者会导致企业的破产倒闭。近年以来,随着企业潜在的或现有的税务风险而致使其破产的事例越来越多,这引起了企业对税务风险的控制的日益重视。而内部控制作为有效管理税务风险的手段之一,企业已经越来越重视完善有关税务风险的内部控制建设。而医药制造业行业关系国计民生,受到相关政府部门以及社会大众的关注,其对税务风险的控制管理尤为重要。ZY公司是一家集中药研发、生产和贸易为一体的中型中药企业。首先本文以税务风险控制的相关理论为基础,以ZY公司的实际情况作为案例进行分析。然后,通过层次分析法利用资产管理类指标、经营类指标、盈力能力指标、短期偿债能力指标建立数据模型得出相关数据,并将ZY公司的指标与行业指标进行对比,发现近几年来,虽然ZY公司的税务风险保持着低于行业的平均水平,但在2016年时,其开始呈上升的趋势,并且在2017年,略微超过行业的平均税务风险,ZY公司应对此引起必要的重视。接着,进一步利用纳税评估指标对财务数据进行配比分析之后,发现ZY公司可能存在虚增成本、少计收入等不规范行为而导致公司偷漏税,从而给公司带来税务风险的隐患。同时结合对税务风险的定性分析,得出ZY公司存在收入确认、成本费用扣除、资产税务处理、税收优惠政策执行和涉及发票的税务风险。最后,以内部控制五大要素为导向,基于内部控制的角度对ZY公司完善税务风险管理过程,构建税务风险内部控制机制提出合理化对策,一是优化ZY公司税务风险环境控制,通过培养公司税务风险防控意识、增设公司税务风险控制机构和加强对财税人员专业能力的培训考核来实现;二是建立有效的税务风险评估体系,具体包括完善税务风险的识别机制、分析机制及应对机制;三是强化税务风险控制活动,通过优化税务工作流程、建立税务风险预警系统以及建立税务风险自查系统的方式,最终达成监管效果;四是加强税务风险信息沟通,通过开发税务风险控制软件系统和税务风险控制的沟通机制来实现;五是制定税务风险监督与反馈机制。希望这些对策能够有助于其健全公司税务风险的防控体系,并给其他医药制造企业一定的借鉴与启示。